More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0729 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 
570 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  57.58 
 
 
534 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  60.04 
 
 
533 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  59.92 
 
 
533 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  57.39 
 
 
538 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  59.62 
 
 
535 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  57.55 
 
 
538 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  59.28 
 
 
525 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  57.69 
 
 
528 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  57.28 
 
 
538 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 
570 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  59.62 
 
 
533 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  57.09 
 
 
538 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  59.36 
 
 
528 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 
570 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  56.79 
 
 
535 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  100 
 
 
533 aa  1112    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  58.3 
 
 
543 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  60.87 
 
 
534 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 
570 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  59.66 
 
 
533 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  59.66 
 
 
542 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  57.58 
 
 
534 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  59.96 
 
 
538 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  59.96 
 
 
538 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  59.81 
 
 
532 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  56.4 
 
 
537 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  57.82 
 
 
538 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  59.21 
 
 
532 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  56.42 
 
 
550 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 
570 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  56.96 
 
 
537 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  56.96 
 
 
537 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  59.96 
 
 
544 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  57.41 
 
 
538 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  57.47 
 
 
538 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  59.92 
 
 
533 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  59.96 
 
 
532 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  57.14 
 
 
537 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  59.62 
 
 
532 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  56.59 
 
 
537 aa  638    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  56.8 
 
 
535 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  57.82 
 
 
542 aa  634    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  57.39 
 
 
534 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  56.85 
 
 
537 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  56.59 
 
 
537 aa  633  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  56.85 
 
 
537 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  56.61 
 
 
536 aa  632  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  56.67 
 
 
537 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  58.68 
 
 
541 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  56.85 
 
 
537 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  58.21 
 
 
534 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  56.8 
 
 
536 aa  632  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  58.79 
 
 
528 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  56.95 
 
 
561 aa  629  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  58.98 
 
 
528 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  57.82 
 
 
535 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  58.79 
 
 
528 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  55.9 
 
 
538 aa  628  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  57.04 
 
 
537 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  55.87 
 
 
536 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  58.94 
 
 
528 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  56.39 
 
 
532 aa  627  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  56.18 
 
 
539 aa  625  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  56.06 
 
 
555 aa  627  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  58.94 
 
 
528 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  58.08 
 
 
529 aa  625  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  58.17 
 
 
523 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  58.94 
 
 
528 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  55.6 
 
 
533 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  55.6 
 
 
545 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  56.38 
 
 
539 aa  622  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  55.6 
 
 
533 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  55.68 
 
 
543 aa  622  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  58.52 
 
 
533 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  55.41 
 
 
545 aa  618  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  55.14 
 
 
534 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  58.08 
 
 
529 aa  615  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  58.86 
 
 
546 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03543  L-aspartate oxidase  55.31 
 
 
559 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  55.14 
 
 
533 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002490  L-aspartate oxidase  55.84 
 
 
561 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  55.33 
 
 
533 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  54.58 
 
 
540 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1097  L-aspartate oxidase  55.7 
 
 
531 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.565133  normal  0.0527143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  58.12 
 
 
536 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  55.41 
 
 
539 aa  614  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  54.58 
 
 
540 aa  609  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  57.03 
 
 
525 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  59.27 
 
 
529 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  54.39 
 
 
540 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  55.22 
 
 
540 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  54.39 
 
 
540 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  55.15 
 
 
560 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  55.04 
 
 
540 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  55.41 
 
 
539 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  55.04 
 
 
540 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  54.48 
 
 
540 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  54.39 
 
 
540 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  55.04 
 
 
540 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>