More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1193 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  100 
 
 
515 aa  1055    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  95.73 
 
 
515 aa  1023    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  56.41 
 
 
507 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  47.56 
 
 
542 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  47.67 
 
 
528 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  48.18 
 
 
529 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  47.46 
 
 
532 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  48.75 
 
 
532 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  46.42 
 
 
522 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  47.2 
 
 
533 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  49.12 
 
 
538 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  48.14 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  45.44 
 
 
538 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  45.79 
 
 
534 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  44.93 
 
 
533 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  43.97 
 
 
571 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  45.45 
 
 
538 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  45.45 
 
 
538 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  43.07 
 
 
535 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  45.32 
 
 
531 aa  398  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  43.07 
 
 
535 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 
528 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  42.65 
 
 
579 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  42.99 
 
 
535 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 
557 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 
535 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  42.19 
 
 
532 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  44.72 
 
 
531 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  43.89 
 
 
565 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 
534 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  42.7 
 
 
535 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  43.91 
 
 
556 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 
539 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  43.1 
 
 
550 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  43.65 
 
 
545 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 
531 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 
531 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  42.21 
 
 
531 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  44.61 
 
 
534 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 
531 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  45.13 
 
 
576 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 
518 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  43.16 
 
 
531 aa  385  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  43.38 
 
 
528 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  44.1 
 
 
558 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  43.52 
 
 
531 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  42.3 
 
 
533 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  42.22 
 
 
535 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  42.99 
 
 
535 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  44.1 
 
 
557 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  45.86 
 
 
572 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  43.11 
 
 
516 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  44.19 
 
 
863 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  40.91 
 
 
534 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 
538 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  44.06 
 
 
541 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 
609 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  44.02 
 
 
577 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  40.3 
 
 
531 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  46.31 
 
 
575 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  45.89 
 
 
545 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 
534 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 
538 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  41.04 
 
 
533 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  45.51 
 
 
867 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  43.05 
 
 
537 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  41.95 
 
 
537 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 
534 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 
532 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  41.4 
 
 
533 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  42.18 
 
 
536 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  44.3 
 
 
532 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  42.05 
 
 
541 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  42.69 
 
 
531 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 
536 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  41.44 
 
 
525 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 
523 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  43.63 
 
 
529 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  41.67 
 
 
534 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  40.93 
 
 
543 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  41.23 
 
 
538 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  41.53 
 
 
543 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  40.9 
 
 
538 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  43.49 
 
 
532 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
550 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  45.49 
 
 
556 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  43.68 
 
 
532 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  41.57 
 
 
537 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  41.49 
 
 
533 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 
539 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  45.68 
 
 
847 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 
537 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  41.3 
 
 
533 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 
537 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 
536 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  44.34 
 
 
598 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  40.66 
 
 
509 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 
537 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  40.9 
 
 
538 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  43.73 
 
 
533 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>