More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4431 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  68.06 
 
 		 531 aa  671    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 521 aa  1016    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  53.88 
 
 		 537 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  54.06 
 
 		 540 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  52.35 
 
 		 534 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  53.66 
 
 		 539 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  50.98 
 
 		 532 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  53.59 
 
 		 538 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  55.19 
 
 		 532 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  49.8 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  47.47 
 
 		 516 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  45.22 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  47.67 
 
 		 519 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  49.37 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  46.09 
 
 		 517 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  49.36 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  46.41 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  48.4 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  44.64 
 
 		 512 aa  360  3e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  45.76 
 
 		 517 aa  359  7e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  47.1 
 
 		 547 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  46.67 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  45.71 
 
 		 518 aa  355  7.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  47.21 
 
 		 532 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.83 
 
 		 499 aa  350  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  47.35 
 
 		 509 aa  346  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  51.26 
 
 		 506 aa  346  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  47.65 
 
 		 513 aa  336  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  36.63 
 
 		 532 aa  336  7e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  43.23 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  48.4 
 
 		 507 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  45.58 
 
 		 502 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  37.86 
 
 		 542 aa  329  7e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 		 535 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  46.25 
 
 		 513 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  41.47 
 
 		 867 aa  319  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  36.65 
 
 		 538 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  43.14 
 
 		 548 aa  317  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  40.31 
 
 		 515 aa  316  8e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  45.84 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  36.97 
 
 		 534 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  39.93 
 
 		 577 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  40.54 
 
 		 557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  38.03 
 
 		 565 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  37.79 
 
 		 532 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  43.08 
 
 		 572 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 		 847 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  39.73 
 
 		 515 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  41.72 
 
 		 863 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  43.85 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  40.2 
 
 		 529 aa  306  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  38.9 
 
 		 528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  37.31 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 		 522 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  40.43 
 
 		 538 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  40.43 
 
 		 538 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  40.93 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  35.77 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  38.09 
 
 		 556 aa  300  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  36.99 
 
 		 531 aa  300  6e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  41.99 
 
 		 549 aa  299  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  41.5 
 
 		 558 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  36.1 
 
 		 531 aa  296  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  36.76 
 
 		 571 aa  296  7e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  38.82 
 
 		 545 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  35.77 
 
 		 537 aa  294  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  41.77 
 
 		 575 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  38.46 
 
 		 533 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  40.95 
 
 		 538 aa  292  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  43.26 
 
 		 572 aa  292  9e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  35.45 
 
 		 531 aa  292  9e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  42.19 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  38.92 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  38.96 
 
 		 525 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  37.97 
 
 		 558 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  41.42 
 
 		 566 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  37.97 
 
 		 557 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  41.01 
 
 		 541 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  35.89 
 
 		 531 aa  286  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  40.35 
 
 		 541 aa  286  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  43.25 
 
 		 872 aa  286  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  36.11 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  42.68 
 
 		 556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  38.95 
 
 		 533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  38.95 
 
 		 545 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  38.95 
 
 		 533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  41.3 
 
 		 589 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  35.46 
 
 		 509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  37.64 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  36.59 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  39.46 
 
 		 533 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  37.28 
 
 		 535 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  35.26 
 
 		 509 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  34.8 
 
 		 532 aa  283  6.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  37.96 
 
 		 540 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  38.2 
 
 		 540 aa  282  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  35.46 
 
 		 509 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  35.46 
 
 		 509 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  38.46 
 
 		 530 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  34.23 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>