More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4756 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 517 aa  1006    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  64.33 
 
 		 517 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  59.88 
 
 		 506 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  54.76 
 
 		 516 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  59.92 
 
 		 522 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  60.56 
 
 		 509 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  56.57 
 
 		 519 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  60.63 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  57.17 
 
 		 513 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  60.08 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  52.97 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  52.75 
 
 		 512 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  53.69 
 
 		 518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  53.71 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  50 
 
 		 537 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  52.15 
 
 		 509 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  52.15 
 
 		 509 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.74 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  53.16 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  46.12 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  49.18 
 
 		 534 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  48.06 
 
 		 531 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  50.52 
 
 		 509 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  49.8 
 
 		 540 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  49.6 
 
 		 539 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  50.7 
 
 		 538 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  54.2 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  48.88 
 
 		 532 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  50.72 
 
 		 507 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  39.88 
 
 		 532 aa  349  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  45.36 
 
 		 521 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  44.69 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  39.45 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  45.51 
 
 		 566 aa  325  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  43.6 
 
 		 847 aa  323  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  40.64 
 
 		 515 aa  322  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  36.71 
 
 		 535 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  37.17 
 
 		 542 aa  320  6e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 		 515 aa  319  9e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  45.34 
 
 		 548 aa  317  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  37.28 
 
 		 555 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  41.85 
 
 		 863 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  36.38 
 
 		 525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  37.28 
 
 		 555 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  43.53 
 
 		 545 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  36.64 
 
 		 538 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  42.7 
 
 		 532 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  37.48 
 
 		 555 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  40.27 
 
 		 533 aa  310  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  39.57 
 
 		 528 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  37.24 
 
 		 566 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  44.21 
 
 		 547 aa  310  5e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  37.24 
 
 		 566 aa  310  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  49.19 
 
 		 506 aa  309  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  41.3 
 
 		 522 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  41.29 
 
 		 575 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  38.85 
 
 		 556 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  41.2 
 
 		 507 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  41.89 
 
 		 572 aa  306  7e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  41.06 
 
 		 543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  39.89 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  42.21 
 
 		 577 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  36.73 
 
 		 532 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  41.08 
 
 		 529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01121  L-aspartate oxidase  37.16 
 
 		 555 aa  303  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.517709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  35.92 
 
 		 519 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  41.3 
 
 		 529 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  41.3 
 
 		 529 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  43.2 
 
 		 867 aa  299  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.99 
 
 		 472 aa  299  8e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  36.87 
 
 		 534 aa  299  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2477  L-aspartate oxidase  43.68 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01131  L-aspartate oxidase  37.43 
 
 		 562 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2335  L-aspartate oxidase  46.37 
 
 		 552 aa  296  6e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  40 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  39.24 
 
 		 545 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  41.89 
 
 		 558 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  36.29 
 
 		 516 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  37.88 
 
 		 531 aa  294  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  35.67 
 
 		 531 aa  293  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  35.55 
 
 		 531 aa  291  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  35.74 
 
 		 531 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  39.01 
 
 		 533 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  35.03 
 
 		 509 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  37.69 
 
 		 539 aa  290  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 548 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 548 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  36.01 
 
 		 531 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  41.93 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  38.94 
 
 		 550 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  43 
 
 		 535 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  43.04 
 
 		 571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  37.65 
 
 		 533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  38.68 
 
 		 533 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  34.56 
 
 		 528 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  38.68 
 
 		 533 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  43.57 
 
 		 565 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  39.25 
 
 		 609 aa  286  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  34.9 
 
 		 509 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  37.5 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>