More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1974 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 472 aa  951    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  59.04 
 
 		 483 aa  570  1e-161  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  39.41 
 
 		 515 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 		 532 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  38.29 
 
 		 516 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  38.55 
 
 		 515 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  36.73 
 
 		 545 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  37 
 
 		 556 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  37.81 
 
 		 565 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  38.43 
 
 		 529 aa  299  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  36.66 
 
 		 533 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  37.14 
 
 		 545 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  36.47 
 
 		 533 aa  299  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  37.96 
 
 		 516 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  37.14 
 
 		 533 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  37.14 
 
 		 533 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  37.33 
 
 		 539 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  37.09 
 
 		 534 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  37.79 
 
 		 518 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  35.7 
 
 		 538 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  38.9 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  35.51 
 
 		 538 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  36.83 
 
 		 525 aa  289  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  37.79 
 
 		 571 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  37.36 
 
 		 540 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  38.61 
 
 		 541 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  37.36 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2375  L-aspartate oxidase  35.86 
 
 		 559 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  37.53 
 
 		 534 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  37.36 
 
 		 540 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  36.85 
 
 		 533 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  37.73 
 
 		 511 aa  286  4e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  36.97 
 
 		 539 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  36.45 
 
 		 541 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  36.35 
 
 		 539 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  37.16 
 
 		 540 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  36.5 
 
 		 540 aa  285  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  36.45 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  35.66 
 
 		 543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  36.45 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  35.19 
 
 		 535 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  36.54 
 
 		 533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  36.26 
 
 		 540 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  39.71 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  36.45 
 
 		 530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 		 538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 		 538 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  34.87 
 
 		 534 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  37.98 
 
 		 532 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  36.26 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  36.31 
 
 		 550 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  36.58 
 
 		 540 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  35 
 
 		 534 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  36.21 
 
 		 540 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  37.99 
 
 		 517 aa  282  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  35.74 
 
 		 534 aa  282  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  35 
 
 		 534 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  37.17 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  36.69 
 
 		 548 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  35.84 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  34.7 
 
 		 543 aa  281  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  35.51 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  35.71 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  36.01 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  35.61 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  35.71 
 
 		 539 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  35.56 
 
 		 538 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  35.7 
 
 		 543 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  34.6 
 
 		 542 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  35.56 
 
 		 537 aa  280  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  35.71 
 
 		 509 aa  279  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  38.1 
 
 		 542 aa  279  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  36.26 
 
 		 538 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  36.95 
 
 		 513 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  36.69 
 
 		 533 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  35.62 
 
 		 545 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  36.66 
 
 		 519 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  36.87 
 
 		 540 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  37.42 
 
 		 534 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  35.4 
 
 		 532 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  36.12 
 
 		 509 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  36.35 
 
 		 528 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  35.96 
 
 		 509 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  36.35 
 
 		 532 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  35.87 
 
 		 555 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  34.03 
 
 		 529 aa  276  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  35.96 
 
 		 509 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  35.96 
 
 		 509 aa  276  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  34.93 
 
 		 536 aa  276  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  35.5 
 
 		 609 aa  275  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  35.63 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  34.67 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  37.89 
 
 		 517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  36.68 
 
 		 541 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  37.23 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  35.27 
 
 		 532 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  34.69 
 
 		 531 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  35.76 
 
 		 509 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  34.37 
 
 		 535 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0614  L-aspartate oxidase  35.86 
 
 		 549 aa  273  4.0000000000000004e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>