More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3493 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 522 aa  1031    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  62.96 
 
 		 506 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  65.12 
 
 		 509 aa  609  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  65.42 
 
 		 506 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  58.64 
 
 		 517 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 		 517 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  57.28 
 
 		 519 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  55.38 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  62.04 
 
 		 513 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  53.66 
 
 		 512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  57 
 
 		 513 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  53.66 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  54.91 
 
 		 502 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  51.67 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  48.51 
 
 		 532 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  47.59 
 
 		 537 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  52.41 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  52.88 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  53.32 
 
 		 509 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.2 
 
 		 499 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  47.49 
 
 		 534 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  55.51 
 
 		 501 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  52.1 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  47.61 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  50.82 
 
 		 532 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  47.49 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  48.28 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  46.6 
 
 		 531 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  42.15 
 
 		 532 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  50.71 
 
 		 507 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 		 541 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  48.33 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  43.11 
 
 		 515 aa  356  6.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  43.92 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  40.45 
 
 		 538 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  39.76 
 
 		 519 aa  346  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  40.36 
 
 		 525 aa  343  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.99 
 
 		 535 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  40.59 
 
 		 516 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  37.98 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  38.72 
 
 		 542 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  43.35 
 
 		 863 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  41.93 
 
 		 543 aa  333  6e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  42.73 
 
 		 577 aa  332  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 		 847 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  38.18 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  38.18 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  44.34 
 
 		 566 aa  330  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  40.28 
 
 		 528 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  42.19 
 
 		 529 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  37.98 
 
 		 509 aa  329  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  37.8 
 
 		 509 aa  329  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  44.05 
 
 		 598 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  37.78 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  37.93 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  45.08 
 
 		 545 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  37.78 
 
 		 509 aa  327  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  45.72 
 
 		 532 aa  326  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3145  L-aspartate oxidase  38.65 
 
 		 502 aa  325  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0480414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  42.71 
 
 		 507 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 		 575 aa  325  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  39.68 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  48.45 
 
 		 506 aa  323  6e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  39.3 
 
 		 534 aa  322  8e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 		 532 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  42.51 
 
 		 867 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  40.32 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  43.2 
 
 		 548 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  38.93 
 
 		 545 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4515  L-aspartate oxidase  37.58 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  37.36 
 
 		 528 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  40.63 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 		 550 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  42.22 
 
 		 538 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  43.21 
 
 		 547 aa  313  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  42.97 
 
 		 572 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  39.47 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  36.48 
 
 		 531 aa  310  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  44.51 
 
 		 548 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  44.51 
 
 		 548 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  37.64 
 
 		 555 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  44.51 
 
 		 535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  40.84 
 
 		 533 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  46.96 
 
 		 519 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  37.64 
 
 		 555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  39.15 
 
 		 538 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  39.15 
 
 		 538 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  36.47 
 
 		 566 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  40 
 
 		 528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  37.5 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  40.94 
 
 		 518 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  36.28 
 
 		 566 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  39.65 
 
 		 533 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2477  L-aspartate oxidase  41.96 
 
 		 503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  40.78 
 
 		 557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  36.35 
 
 		 531 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  39.57 
 
 		 533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  43.21 
 
 		 502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>