More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4590 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  74.7 
 
 		 499 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 500 aa  923    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  66.39 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  65.98 
 
 		 509 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  66.46 
 
 		 509 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  64.48 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  53.71 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  54.6 
 
 		 534 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  52 
 
 		 517 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  52.74 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  53.8 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  53.49 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  52.32 
 
 		 537 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  53.88 
 
 		 509 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  52.77 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  48.74 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  51.93 
 
 		 540 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  52.94 
 
 		 538 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  53.57 
 
 		 519 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  46.68 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  51.64 
 
 		 518 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  52.5 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  52.87 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  46.48 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  53.77 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  50.63 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  54.05 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  46.84 
 
 		 531 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  47.02 
 
 		 863 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  49.24 
 
 		 558 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  49.9 
 
 		 566 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  52.77 
 
 		 501 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  43.82 
 
 		 541 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  47.95 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 		 847 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  48.51 
 
 		 545 aa  339  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  48.01 
 
 		 548 aa  330  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  46.99 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  46.46 
 
 		 867 aa  326  6e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  46.42 
 
 		 521 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  49.32 
 
 		 532 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  46.91 
 
 		 572 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  39.48 
 
 		 532 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.64 
 
 		 542 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  38.4 
 
 		 532 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  38.76 
 
 		 519 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  37.87 
 
 		 509 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  50.1 
 
 		 872 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  37.82 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  38.49 
 
 		 509 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  39.56 
 
 		 535 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  37.48 
 
 		 509 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  37.43 
 
 		 509 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  45.13 
 
 		 557 aa  309  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  45.19 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  46.98 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  38.48 
 
 		 509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  38.31 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  38.31 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  43.29 
 
 		 529 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  49.89 
 
 		 506 aa  305  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  46.22 
 
 		 572 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2477  L-aspartate oxidase  47.4 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  39.89 
 
 		 565 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  39.65 
 
 		 515 aa  302  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  40.47 
 
 		 515 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  42.54 
 
 		 543 aa  301  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 522 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  40.49 
 
 		 556 aa  297  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  37.84 
 
 		 534 aa  296  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  37.88 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 		 577 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  40.66 
 
 		 550 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  36.35 
 
 		 538 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  39.96 
 
 		 528 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  38.95 
 
 		 556 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  39.8 
 
 		 513 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  39.38 
 
 		 532 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  37.4 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  47.12 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  42.55 
 
 		 535 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  44.78 
 
 		 538 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.66 
 
 		 472 aa  290  4e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  36.85 
 
 		 531 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 		 535 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 		 535 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  42.13 
 
 		 541 aa  290  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4515  L-aspartate oxidase  38.08 
 
 		 509 aa  290  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  37.21 
 
 		 566 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  46.63 
 
 		 548 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  46.63 
 
 		 548 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  38.98 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  47.13 
 
 		 527 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 		 536 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  36.19 
 
 		 555 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 		 536 aa  287  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  37.94 
 
 		 516 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 		 533 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  36.63 
 
 		 531 aa  286  5e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  39.39 
 
 		 538 aa  286  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>