More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1433 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 532 aa  1014    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  62.5 
 
 		 540 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  62.43 
 
 		 534 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  62.21 
 
 		 539 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  59.56 
 
 		 532 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  62.23 
 
 		 538 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  59.36 
 
 		 537 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  54.91 
 
 		 531 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  52.33 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  52.61 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  52.61 
 
 		 509 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  56.28 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  53.12 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  50.97 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  50.67 
 
 		 519 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  50.63 
 
 		 522 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  46.75 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  51.44 
 
 		 509 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  51.13 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  49.12 
 
 		 517 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  52.36 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  45.93 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  49.28 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  39.6 
 
 		 532 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  49.42 
 
 		 499 aa  360  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  49.22 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  58.78 
 
 		 547 aa  357  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  52.67 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  50.32 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  54.49 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  47.08 
 
 		 502 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  47.48 
 
 		 518 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  40.64 
 
 		 538 aa  349  9e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.86 
 
 		 535 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  39.06 
 
 		 532 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  43.6 
 
 		 863 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  43.74 
 
 		 847 aa  342  9e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  44.93 
 
 		 541 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  43.22 
 
 		 577 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 		 533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  37.5 
 
 		 542 aa  335  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 		 533 aa  334  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  50.74 
 
 		 513 aa  333  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  41.72 
 
 		 541 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  44.9 
 
 		 867 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  39.56 
 
 		 534 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  45.01 
 
 		 558 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  37.13 
 
 		 519 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  43.5 
 
 		 530 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  42.15 
 
 		 529 aa  329  8e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  48.19 
 
 		 556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  43.04 
 
 		 545 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  41.57 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  43.15 
 
 		 507 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  40.94 
 
 		 538 aa  327  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  40.94 
 
 		 538 aa  327  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  38.64 
 
 		 543 aa  326  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  43.11 
 
 		 598 aa  326  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  42.25 
 
 		 541 aa  325  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  41.78 
 
 		 522 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  41.38 
 
 		 533 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  46.08 
 
 		 548 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  41.83 
 
 		 528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  42.6 
 
 		 543 aa  321  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 		 533 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  41.27 
 
 		 552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  36.77 
 
 		 531 aa  319  7e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  43.73 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  39.96 
 
 		 561 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  38.87 
 
 		 528 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  41.14 
 
 		 575 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  37.62 
 
 		 531 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  42.11 
 
 		 557 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  40.69 
 
 		 552 aa  316  7e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  40.73 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  38.45 
 
 		 532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  43.55 
 
 		 549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  39.3 
 
 		 533 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  39.3 
 
 		 545 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  39.3 
 
 		 533 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  35.52 
 
 		 532 aa  313  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  35.76 
 
 		 509 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  35.76 
 
 		 509 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  38.14 
 
 		 539 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  36.26 
 
 		 528 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0614  L-aspartate oxidase  37.69 
 
 		 549 aa  311  2e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  41.49 
 
 		 515 aa  311  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  35.23 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  37.9 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  38.89 
 
 		 534 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  40 
 
 		 535 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  38.42 
 
 		 535 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  37.85 
 
 		 516 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  38.66 
 
 		 525 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 		 535 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  35.17 
 
 		 509 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  35.84 
 
 		 509 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  38.54 
 
 		 513 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  39.93 
 
 		 565 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  44.97 
 
 		 872 aa  309  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>