More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2017 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  67.5 
 
 		 533 aa  712    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 		 570 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  60.61 
 
 		 533 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  58.91 
 
 		 543 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  66.42 
 
 		 533 aa  698    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  66.54 
 
 		 528 aa  694    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  57.58 
 
 		 532 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  59.93 
 
 		 538 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 		 535 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 541 aa  1102    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  66.16 
 
 		 528 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  59.43 
 
 		 534 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  60.99 
 
 		 525 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  61.77 
 
 		 545 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 		 570 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  67.49 
 
 		 528 aa  723    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  61.78 
 
 		 541 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 		 533 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  59.51 
 
 		 538 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  62.55 
 
 		 532 aa  675    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  67.11 
 
 		 528 aa  715    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  64.22 
 
 		 529 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  72.11 
 
 		 552 aa  811    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 		 570 aa  704    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  73.76 
 
 		 552 aa  834    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  65.59 
 
 		 532 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  61.54 
 
 		 534 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 545 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  60.61 
 
 		 533 aa  636    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  63.88 
 
 		 534 aa  694    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  65.92 
 
 		 533 aa  703    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  61.45 
 
 		 542 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  59.93 
 
 		 538 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  67.5 
 
 		 533 aa  713    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  58.49 
 
 		 538 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  58.49 
 
 		 538 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  62.88 
 
 		 541 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  60.71 
 
 		 539 aa  642    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  65.78 
 
 		 532 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  62.6 
 
 		 525 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 		 570 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  67.16 
 
 		 535 aa  717    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  86.48 
 
 		 530 aa  938    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  64.57 
 
 		 523 aa  663    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  66.16 
 
 		 528 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  61.11 
 
 		 539 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  59.77 
 
 		 535 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  66.73 
 
 		 528 aa  705    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  59.74 
 
 		 538 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 533 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  66.16 
 
 		 528 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  66.73 
 
 		 528 aa  705    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  64.22 
 
 		 529 aa  657    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 533 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  65.78 
 
 		 532 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  57.62 
 
 		 543 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 		 570 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  59.24 
 
 		 534 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  58.4 
 
 		 538 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  58.69 
 
 		 538 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  59.24 
 
 		 534 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  59.2 
 
 		 550 aa  633  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  60 
 
 		 536 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  59.13 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 540 aa  628  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  60.54 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  60.54 
 
 		 539 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  62.7 
 
 		 536 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  59.24 
 
 		 537 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  59.77 
 
 		 530 aa  628  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  60.54 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  60.15 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  60.38 
 
 		 540 aa  630  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  60.54 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  60.34 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  56.98 
 
 		 539 aa  627  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  63.07 
 
 		 528 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 540 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  57.98 
 
 		 542 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  58.33 
 
 		 537 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  58.86 
 
 		 537 aa  621  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  57.2 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  57.88 
 
 		 560 aa  620  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  57.39 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  57.39 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  57.77 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  57.39 
 
 		 537 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  57.77 
 
 		 537 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  57.77 
 
 		 537 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  63.41 
 
 		 544 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  57.03 
 
 		 538 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  63.5 
 
 		 529 aa  621  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  57.77 
 
 		 537 aa  621  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  58.67 
 
 		 536 aa  618  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  57.38 
 
 		 538 aa  615  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  58.29 
 
 		 536 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  57.9 
 
 		 537 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>