More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2883 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  67.35 
 
 		 872 aa  1006    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  62.34 
 
 		 863 aa  960    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 867 aa  1700    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  63.69 
 
 		 847 aa  949    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  65.91 
 
 		 545 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  62.4 
 
 		 575 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  58.48 
 
 		 557 aa  558  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  60.38 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  61.69 
 
 		 558 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  60.07 
 
 		 566 aa  544  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  58.05 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  54.99 
 
 		 577 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  58.38 
 
 		 548 aa  504  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  59.46 
 
 		 549 aa  500  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  59.2 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  56.36 
 
 		 572 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  55.01 
 
 		 589 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  47.08 
 
 		 532 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  42.53 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  42.52 
 
 		 534 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  48.03 
 
 		 538 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  49.36 
 
 		 538 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  47.4 
 
 		 529 aa  389  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  49.29 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  45.44 
 
 		 522 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  40 
 
 		 532 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  45.77 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  49.12 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  45.51 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  44.55 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  40.57 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  41.49 
 
 		 538 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  44.13 
 
 		 528 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  43.07 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  47.24 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  47.24 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  43.41 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  47.06 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  44.1 
 
 		 533 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  48.9 
 
 		 538 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  43.5 
 
 		 534 aa  366  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  43.18 
 
 		 534 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  40.37 
 
 		 531 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  47.83 
 
 		 519 aa  363  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  43.53 
 
 		 556 aa  363  9e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  39.81 
 
 		 531 aa  362  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  45.51 
 
 		 532 aa  362  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  38.48 
 
 		 531 aa  362  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  44.49 
 
 		 532 aa  361  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  45.71 
 
 		 523 aa  360  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  40.97 
 
 		 531 aa  360  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  42.25 
 
 		 537 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  43.07 
 
 		 542 aa  359  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  42.4 
 
 		 537 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  42.4 
 
 		 537 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  42.4 
 
 		 537 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 		 539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  44.05 
 
 		 533 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  42.4 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  41.95 
 
 		 540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  45.23 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  45.25 
 
 		 533 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  43.3 
 
 		 543 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  40.73 
 
 		 555 aa  357  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 		 532 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  44.26 
 
 		 532 aa  357  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  40.86 
 
 		 532 aa  357  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  40.07 
 
 		 528 aa  357  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  43.87 
 
 		 533 aa  357  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  41.94 
 
 		 533 aa  356  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 		 531 aa  356  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  42.38 
 
 		 534 aa  356  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  47.48 
 
 		 514 aa  356  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  41.77 
 
 		 540 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  41.7 
 
 		 537 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 		 540 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  41.08 
 
 		 565 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  42.99 
 
 		 538 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  42.99 
 
 		 538 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  38.85 
 
 		 531 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  41.88 
 
 		 536 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 		 531 aa  354  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 		 540 aa  354  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  40.6 
 
 		 536 aa  353  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  39.26 
 
 		 535 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  40.6 
 
 		 536 aa  353  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 		 531 aa  353  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 		 533 aa  353  7e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 		 537 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 		 537 aa  353  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.56 
 
 		 531 aa  353  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  43.97 
 
 		 528 aa  353  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  42.81 
 
 		 546 aa  353  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  46.29 
 
 		 539 aa  353  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  41.41 
 
 		 539 aa  353  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 		 533 aa  352  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  41.41 
 
 		 539 aa  352  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 		 531 aa  351  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  42.37 
 
 		 534 aa  351  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>