More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3618 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  71.98 
 
 
535 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  100 
 
 
519 aa  1008    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  72.37 
 
 
548 aa  676    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  72.37 
 
 
548 aa  676    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  81.64 
 
 
514 aa  763    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  72.13 
 
 
527 aa  628  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  57.4 
 
 
533 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  56.95 
 
 
538 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  54.65 
 
 
557 aa  425  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  51.52 
 
 
863 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2011  L-aspartate oxidase  54.15 
 
 
482 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  50.97 
 
 
545 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  52.29 
 
 
538 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  47.01 
 
 
557 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  47.83 
 
 
867 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  49.23 
 
 
847 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  48.75 
 
 
558 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  49.15 
 
 
872 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  48.29 
 
 
572 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  48.96 
 
 
598 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  49.91 
 
 
566 aa  369  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  49.19 
 
 
548 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  47.39 
 
 
575 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  44.78 
 
 
577 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  47.84 
 
 
572 aa  355  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  47.92 
 
 
549 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  44.93 
 
 
533 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  44.93 
 
 
533 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  44.02 
 
 
542 aa  349  9e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  42.19 
 
 
532 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  48.29 
 
 
572 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  44.64 
 
 
532 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  45.61 
 
 
528 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  44.03 
 
 
529 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  39.88 
 
 
532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  45.42 
 
 
533 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  43.43 
 
 
533 aa  340  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  41.86 
 
 
536 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 
570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 
570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 
570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 
570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 
570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 
535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  42.08 
 
 
537 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  42.72 
 
 
545 aa  337  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 
533 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  43.49 
 
 
535 aa  336  5e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  44.97 
 
 
533 aa  336  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  41.78 
 
 
537 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  41.78 
 
 
537 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  43.08 
 
 
538 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  43.08 
 
 
538 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  41.78 
 
 
537 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  44.01 
 
 
528 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  40.32 
 
 
538 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 
537 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  44.15 
 
 
532 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  44.01 
 
 
528 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  43.24 
 
 
539 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  39.93 
 
 
534 aa  333  4e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  41.25 
 
 
535 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 
534 aa  333  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  44.86 
 
 
507 aa  333  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 
537 aa  333  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  43.61 
 
 
528 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 
533 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  41.04 
 
 
533 aa  332  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 
561 aa  332  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  43.63 
 
 
528 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 
537 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  43.63 
 
 
528 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  38.99 
 
 
579 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 
537 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  43.63 
 
 
528 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 
531 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  43.42 
 
 
532 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  40.91 
 
 
537 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  42.15 
 
 
555 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  40.91 
 
 
537 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  40.91 
 
 
536 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  43.42 
 
 
532 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  42.52 
 
 
541 aa  329  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 
537 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  40.81 
 
 
533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  40.24 
 
 
509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  40.95 
 
 
538 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  40.45 
 
 
536 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  39.51 
 
 
541 aa  326  7e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  43.61 
 
 
528 aa  326  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 
539 aa  326  7e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  39.74 
 
 
531 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  42.61 
 
 
535 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  43.15 
 
 
546 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 
538 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  43.57 
 
 
502 aa  324  3e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 
532 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  43.4 
 
 
541 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  39.62 
 
 
531 aa  323  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 
550 aa  322  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>