More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4551 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 533 aa  1023    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  57.4 
 
 		 519 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  55.23 
 
 		 535 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  54.83 
 
 		 548 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  54.83 
 
 		 548 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  57.49 
 
 		 514 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  54.11 
 
 		 527 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2011  L-aspartate oxidase  57.67 
 
 		 482 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  52.85 
 
 		 538 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  51.05 
 
 		 557 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  52.8 
 
 		 538 aa  360  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  47.22 
 
 		 863 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  48.18 
 
 		 545 aa  346  7e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  45.96 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  47.88 
 
 		 558 aa  345  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  47.68 
 
 		 847 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  43.86 
 
 		 867 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  44.47 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  45.47 
 
 		 557 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.92 
 
 		 542 aa  329  9e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  43.09 
 
 		 577 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  48.54 
 
 		 548 aa  326  7e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  43.59 
 
 		 575 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  43.47 
 
 		 538 aa  323  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  49.61 
 
 		 872 aa  323  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  37.48 
 
 		 538 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 		 545 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  37.4 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  45.56 
 
 		 572 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  37.41 
 
 		 534 aa  319  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  42.02 
 
 		 528 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  43.21 
 
 		 535 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 		 535 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  46.53 
 
 		 549 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 		 522 aa  312  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.72 
 
 		 532 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  41.62 
 
 		 535 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 		 579 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 533 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  42.69 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 535 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  44.85 
 
 		 598 aa  306  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  42.21 
 
 		 502 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  44.16 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  40.59 
 
 		 543 aa  303  6.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  37.96 
 
 		 509 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  45.6 
 
 		 572 aa  303  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  41.73 
 
 		 541 aa  302  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  45.68 
 
 		 566 aa  302  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  39.4 
 
 		 542 aa  299  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  39.85 
 
 		 532 aa  299  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  42.1 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  37.57 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  39.38 
 
 		 515 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2559  L-aspartate oxidase  50 
 
 		 591 aa  296  8e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.617857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  40.71 
 
 		 513 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  39.39 
 
 		 534 aa  295  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  41.19 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  37.02 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  38.97 
 
 		 533 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2296  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 		 550 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000882824 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  40.68 
 
 		 546 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  42.21 
 
 		 544 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  38.46 
 
 		 516 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  36.75 
 
 		 519 aa  293  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  38.79 
 
 		 515 aa  293  7e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  38.42 
 
 		 533 aa  292  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  41.02 
 
 		 512 aa  293  8e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  38.68 
 
 		 537 aa  292  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  36.82 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  37.21 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  38.46 
 
 		 561 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  40.39 
 
 		 541 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  40.9 
 
 		 518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  36.71 
 
 		 535 aa  290  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1550  L-aspartate oxidase  41.05 
 
 		 515 aa  290  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  37.52 
 
 		 533 aa  290  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  37.28 
 
 		 509 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  37.28 
 
 		 509 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  39.85 
 
 		 541 aa  289  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  38.11 
 
 		 539 aa  289  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  37.17 
 
 		 539 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  35.19 
 
 		 532 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0862  L-aspartate oxidase  38.11 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  36.85 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  37.22 
 
 		 555 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  37.4 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  38.33 
 
 		 540 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  38.15 
 
 		 539 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  39.67 
 
 		 533 aa  287  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  38.33 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  39.78 
 
 		 563 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  36.6 
 
 		 539 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  41.27 
 
 		 534 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  36.53 
 
 		 545 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  36.97 
 
 		 540 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  36.53 
 
 		 533 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  36.53 
 
 		 533 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  39.02 
 
 		 537 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  37.81 
 
 		 537 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>