More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2011 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2011  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 482 aa  927    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  58.64 
 
 		 533 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  54.04 
 
 		 535 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  53.7 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  53.7 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  54.15 
 
 		 519 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  54.04 
 
 		 527 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  53.73 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  53.35 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  50.11 
 
 		 558 aa  348  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  47.37 
 
 		 575 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  47.79 
 
 		 847 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  46.73 
 
 		 863 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  52.09 
 
 		 538 aa  342  5.999999999999999e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  51.99 
 
 		 538 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  46.52 
 
 		 545 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  44.83 
 
 		 867 aa  333  5e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  48.72 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  49.03 
 
 		 548 aa  326  6e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  44.2 
 
 		 557 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  46.88 
 
 		 572 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  46.24 
 
 		 566 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 		 533 aa  317  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 507 aa  313  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  47.35 
 
 		 598 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  43.15 
 
 		 529 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  47.61 
 
 		 545 aa  306  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  46.8 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  38.21 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  40.22 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  40.65 
 
 		 533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  42.54 
 
 		 522 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  37.98 
 
 		 532 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  45.95 
 
 		 572 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  46.88 
 
 		 872 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  37.52 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  44.5 
 
 		 531 aa  299  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  40.56 
 
 		 534 aa  299  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  39.87 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  44.23 
 
 		 534 aa  298  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  36.22 
 
 		 534 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  38.4 
 
 		 531 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  47.24 
 
 		 577 aa  293  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  36.76 
 
 		 532 aa  292  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  46.23 
 
 		 528 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  40.44 
 
 		 541 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  43.07 
 
 		 541 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  44.59 
 
 		 538 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  42.36 
 
 		 532 aa  289  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  44.39 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  38.8 
 
 		 533 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  40.16 
 
 		 502 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  38.8 
 
 		 533 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  38.8 
 
 		 545 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  45.82 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  38.27 
 
 		 533 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  38.08 
 
 		 533 aa  286  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  37.12 
 
 		 528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  37.22 
 
 		 542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  36.31 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 		 570 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 		 570 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 		 570 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 		 570 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 		 570 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 		 533 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  45.43 
 
 		 543 aa  283  7.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 		 535 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  40.78 
 
 		 571 aa  282  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  45.12 
 
 		 516 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  40.47 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  37.64 
 
 		 539 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  38.68 
 
 		 545 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  40.86 
 
 		 533 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4056  L-aspartate oxidase  38.16 
 
 		 507 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.916074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  37.12 
 
 		 531 aa  280  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 		 540 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2775  L-aspartate oxidase  47.31 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  37.33 
 
 		 539 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  47.07 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  34.05 
 
 		 537 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  42.82 
 
 		 535 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  40.55 
 
 		 532 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  38.74 
 
 		 539 aa  277  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 535 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  40.94 
 
 		 533 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  41.85 
 
 		 540 aa  276  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  38.61 
 
 		 534 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  37.72 
 
 		 540 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 535 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 		 528 aa  276  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  37.33 
 
 		 539 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  37.69 
 
 		 534 aa  276  7e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  40.35 
 
 		 532 aa  276  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4734  L-aspartate oxidase  38.3 
 
 		 526 aa  276  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  42.09 
 
 		 540 aa  276  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  41.61 
 
 		 540 aa  276  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  41.61 
 
 		 540 aa  276  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  41.85 
 
 		 540 aa  275  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  37.52 
 
 		 540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>