More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4734 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  60.42 
 
 		 528 aa  666    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4734  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 526 aa  1097    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  58.97 
 
 		 532 aa  650    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  78.71 
 
 		 528 aa  834    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  54.3 
 
 		 533 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  52.21 
 
 		 531 aa  558  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  52.86 
 
 		 531 aa  554  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  52.41 
 
 		 531 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  51.72 
 
 		 531 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  52.22 
 
 		 537 aa  548  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  52.41 
 
 		 531 aa  544  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  52.11 
 
 		 531 aa  538  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  50.48 
 
 		 533 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  50.1 
 
 		 533 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  50.1 
 
 		 532 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  49.71 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  49.53 
 
 		 531 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  49.62 
 
 		 534 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  49.9 
 
 		 531 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  50.09 
 
 		 541 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  49.62 
 
 		 531 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  47.8 
 
 		 539 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  48.85 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  48 
 
 		 532 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  48.27 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  48.46 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  47.16 
 
 		 537 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  46.95 
 
 		 538 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  46.95 
 
 		 538 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  46.97 
 
 		 537 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  46.97 
 
 		 537 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  46.97 
 
 		 537 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  47.27 
 
 		 534 aa  466  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  46.37 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  48.47 
 
 		 532 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  48.65 
 
 		 527 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  46.85 
 
 		 533 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  46.78 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  48.28 
 
 		 532 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  46.55 
 
 		 525 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  46.78 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  47.8 
 
 		 523 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  47.64 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  46.59 
 
 		 537 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  48.28 
 
 		 532 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  46.78 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  46.85 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  46.85 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  48 
 
 		 543 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  46.85 
 
 		 533 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  46.46 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  46.46 
 
 		 533 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  46.21 
 
 		 537 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  45.7 
 
 		 545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  46.48 
 
 		 539 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  46.49 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  47.6 
 
 		 534 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  47.7 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  47.62 
 
 		 541 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  45.83 
 
 		 543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  45.44 
 
 		 550 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  45.64 
 
 		 538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  46.5 
 
 		 538 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  48.28 
 
 		 529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  46.21 
 
 		 534 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  47.43 
 
 		 528 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  45.89 
 
 		 539 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  45.83 
 
 		 538 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  46.4 
 
 		 537 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  46.54 
 
 		 555 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  46.21 
 
 		 534 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  45.99 
 
 		 552 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  45.64 
 
 		 538 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  46.05 
 
 		 579 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  46.01 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  46.08 
 
 		 540 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  46.08 
 
 		 540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  46.3 
 
 		 533 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  45.45 
 
 		 536 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  44.99 
 
 		 538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  45.64 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  45.45 
 
 		 536 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  48.37 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  45.45 
 
 		 536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  47.89 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  46.08 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  46.46 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  46.08 
 
 		 540 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  46.07 
 
 		 539 aa  447  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  46.3 
 
 		 542 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  45.99 
 
 		 533 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  45.18 
 
 		 538 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  47.99 
 
 		 570 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  45.9 
 
 		 541 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  47.99 
 
 		 570 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  46.08 
 
 		 540 aa  445  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  45.98 
 
 		 530 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  46.02 
 
 		 537 aa  445  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  45.64 
 
 		 534 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  46.08 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>