More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4514 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  100 
 
 
527 aa  1075    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  60.89 
 
 
531 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  59.09 
 
 
531 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  58.94 
 
 
531 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  61.49 
 
 
534 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  58.69 
 
 
532 aa  627  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  59.57 
 
 
531 aa  626  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  59.96 
 
 
535 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  57.95 
 
 
533 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  59.36 
 
 
541 aa  615  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  57.95 
 
 
533 aa  616  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  59.85 
 
 
535 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  59.39 
 
 
535 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  60.19 
 
 
535 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  60.65 
 
 
534 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  56.03 
 
 
579 aa  586  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  55.87 
 
 
534 aa  578  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  55.26 
 
 
538 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  55.26 
 
 
538 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  56.43 
 
 
529 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  54.55 
 
 
525 aa  567  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  54.73 
 
 
535 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  56.09 
 
 
523 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  54.01 
 
 
528 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  53.73 
 
 
555 aa  561  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  54.88 
 
 
532 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  55.68 
 
 
533 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  56.05 
 
 
529 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  54.2 
 
 
538 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  52.83 
 
 
531 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  56.17 
 
 
542 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  53.4 
 
 
531 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  53.33 
 
 
538 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  53.61 
 
 
539 aa  557  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  55.07 
 
 
533 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  52.92 
 
 
531 aa  551  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  53.82 
 
 
538 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  51.89 
 
 
533 aa  550  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  53.89 
 
 
533 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  55.85 
 
 
525 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  53.5 
 
 
533 aa  548  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  53.8 
 
 
534 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  52.46 
 
 
534 aa  545  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  54.63 
 
 
541 aa  548  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  51.91 
 
 
539 aa  547  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  53.9 
 
 
534 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  53.7 
 
 
533 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  53.33 
 
 
535 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  52.48 
 
 
538 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  52.38 
 
 
538 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  54.1 
 
 
541 aa  545  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  53.52 
 
 
534 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  56.67 
 
 
529 aa  545  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  51.56 
 
 
531 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  52.29 
 
 
538 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  51.85 
 
 
531 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  54.01 
 
 
532 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  53.44 
 
 
532 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  53.92 
 
 
532 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  52.53 
 
 
543 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  52.01 
 
 
542 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  51.37 
 
 
537 aa  535  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  50.29 
 
 
531 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  52.37 
 
 
535 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  52.37 
 
 
570 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  52.37 
 
 
570 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  50.57 
 
 
539 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  52.37 
 
 
570 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  52.37 
 
 
570 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  52.37 
 
 
570 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  52.38 
 
 
533 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  52.58 
 
 
528 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  56.27 
 
 
528 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  51.15 
 
 
550 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  50.48 
 
 
532 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  52 
 
 
533 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  52 
 
 
536 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  52.9 
 
 
541 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  51.04 
 
 
537 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  52.95 
 
 
560 aa  524  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  50.29 
 
 
533 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  50.29 
 
 
533 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  50.76 
 
 
537 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  53.28 
 
 
530 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  50.76 
 
 
537 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  50.76 
 
 
537 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  50.76 
 
 
537 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  50.47 
 
 
537 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  50.66 
 
 
537 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  50.28 
 
 
537 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  47.53 
 
 
528 aa  518  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  52.01 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  50.66 
 
 
537 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  51.82 
 
 
528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  49.9 
 
 
538 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  50.67 
 
 
533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  50.67 
 
 
545 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  53.47 
 
 
544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  52.01 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  51.82 
 
 
528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>