More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0198 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  79.37 
 
 		 566 aa  808    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  64.09 
 
 		 863 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 598 aa  1162    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  65.47 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  64.85 
 
 		 847 aa  624  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  62.31 
 
 		 572 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  63.18 
 
 		 558 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  63.33 
 
 		 549 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  60.57 
 
 		 575 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  58.36 
 
 		 557 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  60.38 
 
 		 867 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  61.89 
 
 		 572 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  57.63 
 
 		 577 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  57.78 
 
 		 548 aa  548  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  58.25 
 
 		 572 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  58.94 
 
 		 872 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  56.32 
 
 		 589 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  48.02 
 
 		 529 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 532 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  47.62 
 
 		 507 aa  405  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  43.58 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  40.7 
 
 		 534 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.55 
 
 		 542 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  49.45 
 
 		 538 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  41.52 
 
 		 538 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  40.8 
 
 		 532 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  42.73 
 
 		 532 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  45.94 
 
 		 533 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  43.74 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  50.68 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  48.02 
 
 		 538 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  44.53 
 
 		 541 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  44.77 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  44.95 
 
 		 535 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  45.12 
 
 		 535 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  40.37 
 
 		 531 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  44.34 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  48.42 
 
 		 576 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  43.87 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  41.9 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  41.71 
 
 		 533 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  39.43 
 
 		 531 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  48.58 
 
 		 557 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  48.67 
 
 		 548 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  48.67 
 
 		 548 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  48.48 
 
 		 535 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  46.15 
 
 		 502 aa  362  9e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  48.96 
 
 		 519 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  45.96 
 
 		 527 aa  361  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  41.37 
 
 		 579 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 		 545 aa  360  6e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  45.54 
 
 		 534 aa  359  8e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  39.74 
 
 		 531 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  47.06 
 
 		 516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  44.42 
 
 		 535 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  39.85 
 
 		 531 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  41.34 
 
 		 541 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  39.06 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  44.17 
 
 		 529 aa  355  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  45.07 
 
 		 540 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  43.45 
 
 		 522 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  47.72 
 
 		 514 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  42.78 
 
 		 532 aa  353  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  40 
 
 		 531 aa  352  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  38.27 
 
 		 531 aa  352  7e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  44.79 
 
 		 543 aa  352  8.999999999999999e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  38.98 
 
 		 537 aa  352  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  39.66 
 
 		 534 aa  351  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  37.22 
 
 		 528 aa  350  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  43.69 
 
 		 534 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  41.37 
 
 		 538 aa  349  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  41.37 
 
 		 538 aa  349  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  40.75 
 
 		 531 aa  349  9e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  40.41 
 
 		 531 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  43.86 
 
 		 537 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  38.87 
 
 		 528 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  40.39 
 
 		 565 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 		 556 aa  345  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  45.32 
 
 		 556 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  41.63 
 
 		 546 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  44.32 
 
 		 525 aa  343  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  43.21 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  40.68 
 
 		 536 aa  343  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  44.16 
 
 		 523 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  42.48 
 
 		 533 aa  342  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  40.87 
 
 		 537 aa  341  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  39.72 
 
 		 571 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  40.76 
 
 		 537 aa  340  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  42.32 
 
 		 541 aa  340  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4734  L-aspartate oxidase  37.36 
 
 		 526 aa  339  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 		 535 aa  339  9e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  39.62 
 
 		 519 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  39.96 
 
 		 533 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  43.89 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 		 539 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  40.27 
 
 		 536 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  42.06 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  45.11 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  45.11 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 		 537 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>