More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0462 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  65.03 
 
 
863 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  100 
 
 
575 aa  1134    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  67.04 
 
 
847 aa  644    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  64.83 
 
 
545 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  63.34 
 
 
557 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  62.4 
 
 
867 aa  596  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  60.82 
 
 
598 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  60.19 
 
 
577 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  60.78 
 
 
572 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  62.33 
 
 
549 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 
566 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  59.23 
 
 
548 aa  542  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  59.04 
 
 
558 aa  538  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  60.67 
 
 
572 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  60.51 
 
 
872 aa  531  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  60.59 
 
 
572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  56.75 
 
 
589 aa  508  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  48.72 
 
 
532 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  42.47 
 
 
532 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  42.77 
 
 
534 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  45.49 
 
 
515 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  45.6 
 
 
528 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  45.88 
 
 
515 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  46.65 
 
 
529 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  44.79 
 
 
533 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  45.21 
 
 
522 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  41.2 
 
 
542 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  41.49 
 
 
538 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  43.07 
 
 
533 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  47.13 
 
 
507 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  50 
 
 
538 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  45.9 
 
 
541 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  48.34 
 
 
538 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  42.05 
 
 
535 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  41.14 
 
 
531 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  45.4 
 
 
502 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  47.85 
 
 
548 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  47.85 
 
 
548 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  40.88 
 
 
531 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  40.61 
 
 
531 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  41.78 
 
 
532 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  49.44 
 
 
557 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  47.46 
 
 
535 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  43.41 
 
 
556 aa  365  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  41.43 
 
 
545 aa  365  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  41.03 
 
 
509 aa  365  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  43.68 
 
 
565 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  40.83 
 
 
509 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  39.05 
 
 
531 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 
531 aa  360  4e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  49.19 
 
 
538 aa  360  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  47.39 
 
 
519 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  38.93 
 
 
531 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  38.75 
 
 
537 aa  356  7.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  40.43 
 
 
509 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  47.16 
 
 
514 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
509 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
509 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
509 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 
571 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  39.84 
 
 
509 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 
550 aa  350  4e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  41.49 
 
 
539 aa  349  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 
509 aa  349  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  44.2 
 
 
527 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  42.16 
 
 
535 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  36.88 
 
 
532 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  39.64 
 
 
519 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  41.97 
 
 
535 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  42.16 
 
 
535 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  40.9 
 
 
541 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  41.21 
 
 
534 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  43.79 
 
 
534 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  44.53 
 
 
537 aa  343  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  44.55 
 
 
540 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  42.36 
 
 
528 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  41.52 
 
 
609 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  40.83 
 
 
533 aa  340  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  44.29 
 
 
576 aa  339  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  41.02 
 
 
531 aa  339  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  41.21 
 
 
533 aa  339  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  43.95 
 
 
534 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  37.86 
 
 
528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 
540 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  42.86 
 
 
543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  41.22 
 
 
518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.63 
 
 
531 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  43.5 
 
 
529 aa  337  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  40.96 
 
 
540 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  40.96 
 
 
540 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2011  L-aspartate oxidase  47.4 
 
 
482 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  40.26 
 
 
579 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  40.77 
 
 
540 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  40.58 
 
 
539 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  43.53 
 
 
516 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  40.12 
 
 
531 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  39.06 
 
 
531 aa  332  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2296  L-aspartate oxidase  44.03 
 
 
550 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000882824 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 
538 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  41.33 
 
 
538 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>