More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4377 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 566 aa  1090    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  79.37 
 
 		 598 aa  820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  63.8 
 
 		 863 aa  631  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  64.61 
 
 		 545 aa  624  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  64.35 
 
 		 847 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  62.5 
 
 		 572 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  59.19 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  60.82 
 
 		 867 aa  565  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  63.54 
 
 		 549 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  59.46 
 
 		 548 aa  555  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 575 aa  552  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  60.57 
 
 		 558 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  61.36 
 
 		 572 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  56.21 
 
 		 577 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  59.25 
 
 		 872 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2094  L-aspartate oxidase  55.5 
 
 		 589 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  55.98 
 
 		 572 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  45.75 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  41.38 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  50.09 
 
 		 538 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  41 
 
 		 538 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 534 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  39.4 
 
 		 542 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  43.54 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  47.7 
 
 		 507 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  46.56 
 
 		 529 aa  385  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  48.63 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  46.85 
 
 		 538 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  41.58 
 
 		 532 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  38.78 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3165  L-aspartate oxidase  50.87 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000274372  hitchhiker  0.0000603804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  49.43 
 
 		 548 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 		 533 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  49.43 
 
 		 548 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  48.7 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  43.07 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  45.42 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  50.47 
 
 		 519 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  49.25 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  41.99 
 
 		 531 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  42.94 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.22 
 
 		 531 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  39.25 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  39.41 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  43.17 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  38.62 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  45.25 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  39.74 
 
 		 531 aa  365  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  41.44 
 
 		 534 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  42.53 
 
 		 535 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  40.37 
 
 		 531 aa  363  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  42.35 
 
 		 535 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  47.01 
 
 		 576 aa  362  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  45.49 
 
 		 502 aa  360  3e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  38.06 
 
 		 531 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  46.36 
 
 		 527 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  38.66 
 
 		 537 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 		 556 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  37.85 
 
 		 531 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  37.2 
 
 		 528 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  40.48 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 		 535 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  46.05 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  40.31 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  46.62 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  44.29 
 
 		 537 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  41.67 
 
 		 533 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  41.67 
 
 		 533 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  39.93 
 
 		 533 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 		 531 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  43.67 
 
 		 529 aa  351  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  39.01 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  41.17 
 
 		 532 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  43.95 
 
 		 543 aa  347  3e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 		 534 aa  346  6e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  42.03 
 
 		 546 aa  346  8e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  38.89 
 
 		 509 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  40.82 
 
 		 565 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  38.12 
 
 		 509 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  42.48 
 
 		 523 aa  343  5e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  38.81 
 
 		 509 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  38.81 
 
 		 509 aa  343  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  41.85 
 
 		 535 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  39.45 
 
 		 555 aa  342  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  37.93 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  41.28 
 
 		 525 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  41.48 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  40.6 
 
 		 545 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  43.29 
 
 		 529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  38.31 
 
 		 509 aa  340  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  38.86 
 
 		 519 aa  339  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  42.78 
 
 		 541 aa  339  9e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 		 542 aa  339  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  39.89 
 
 		 538 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  39.89 
 
 		 538 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  45.77 
 
 		 539 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  38.29 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  37.71 
 
 		 528 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.792013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>