More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4056 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4056  L-aspartate oxidase  100 
 
 
507 aa  1045    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.916074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  44.51 
 
 
532 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4734  L-aspartate oxidase  43.6 
 
 
526 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734093  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  41.05 
 
 
528 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  43.87 
 
 
528 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  42.29 
 
 
531 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  40.67 
 
 
533 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  41.9 
 
 
531 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  41.11 
 
 
531 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  40.71 
 
 
537 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  40.71 
 
 
531 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  40.58 
 
 
541 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  41.7 
 
 
531 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  40.98 
 
 
531 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  39.13 
 
 
531 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  40.59 
 
 
531 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 
579 aa  361  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  38.2 
 
 
534 aa  360  3e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  39.07 
 
 
533 aa  360  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  39.22 
 
 
534 aa  359  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  38.88 
 
 
533 aa  356  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  37.84 
 
 
537 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 
537 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  38.99 
 
 
543 aa  354  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 
537 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  37.26 
 
 
537 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 
537 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 
537 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 
537 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  37.45 
 
 
537 aa  352  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  37.26 
 
 
537 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  37.64 
 
 
537 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  41.2 
 
 
532 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  39 
 
 
531 aa  349  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  38.24 
 
 
533 aa  347  4e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  37.18 
 
 
867 aa  346  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  37.26 
 
 
536 aa  345  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  38.64 
 
 
532 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  40.94 
 
 
534 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  36.73 
 
 
863 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  36.82 
 
 
535 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  36.87 
 
 
537 aa  342  9e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  39.25 
 
 
538 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  39.25 
 
 
538 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  36.68 
 
 
536 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  36.49 
 
 
536 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  37.35 
 
 
561 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  43.04 
 
 
527 aa  339  8e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  38.6 
 
 
539 aa  339  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  40.59 
 
 
523 aa  339  8e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  42.79 
 
 
541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  37.38 
 
 
538 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  37.67 
 
 
532 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  37.28 
 
 
552 aa  335  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  38.76 
 
 
545 aa  334  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  37.15 
 
 
539 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  37.52 
 
 
552 aa  332  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  38.91 
 
 
541 aa  333  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  37.35 
 
 
534 aa  333  6e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  41.83 
 
 
528 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  38.63 
 
 
529 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  39.64 
 
 
533 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  38.7 
 
 
532 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  36.02 
 
 
550 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  37.03 
 
 
535 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  37.6 
 
 
531 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  38.11 
 
 
536 aa  329  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  43.48 
 
 
550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  38.18 
 
 
532 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  40.48 
 
 
545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  36.74 
 
 
540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  36.74 
 
 
540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  36.74 
 
 
540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  36.94 
 
 
539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  36.74 
 
 
540 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  35.86 
 
 
555 aa  327  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  35.24 
 
 
538 aa  326  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  36.83 
 
 
535 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  43.37 
 
 
529 aa  326  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  43.37 
 
 
529 aa  326  7e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  36.63 
 
 
535 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  36.49 
 
 
533 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  36.27 
 
 
538 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  40.45 
 
 
598 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  36.49 
 
 
545 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  36.49 
 
 
533 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  46.72 
 
 
542 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  36.88 
 
 
542 aa  324  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  36.27 
 
 
538 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  40.35 
 
 
847 aa  324  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  37.15 
 
 
528 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002490  L-aspartate oxidase  36.02 
 
 
561 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  37.74 
 
 
534 aa  323  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  35.77 
 
 
533 aa  323  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  35.77 
 
 
533 aa  322  7e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  37.35 
 
 
544 aa  322  7e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  38.57 
 
 
529 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  38.82 
 
 
529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  37.38 
 
 
528 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  40.63 
 
 
572 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>