More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2362 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 532 aa  1046    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  57.85 
 
 		 534 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  57.69 
 
 		 540 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 		 539 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  57.76 
 
 		 538 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  50.78 
 
 		 532 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  54.17 
 
 		 537 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  50.58 
 
 		 532 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  47.34 
 
 		 531 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  47.21 
 
 		 521 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  46.39 
 
 		 509 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  44.34 
 
 		 517 aa  352  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  43.78 
 
 		 516 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  46.52 
 
 		 509 aa  347  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  43.34 
 
 		 517 aa  346  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  45.42 
 
 		 522 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  45.36 
 
 		 509 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  45.38 
 
 		 519 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  49.12 
 
 		 500 aa  339  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  43.03 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  43.69 
 
 		 506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  44.29 
 
 		 509 aa  329  6e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  43.03 
 
 		 512 aa  322  8e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.09 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  39.17 
 
 		 529 aa  317  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  35.95 
 
 		 532 aa  316  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.31 
 
 		 532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  45.58 
 
 		 513 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  36.24 
 
 		 542 aa  312  9e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  36.24 
 
 		 535 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  41.96 
 
 		 506 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  35.77 
 
 		 538 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  40.36 
 
 		 541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  40.92 
 
 		 518 aa  302  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  45.8 
 
 		 513 aa  299  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  38.07 
 
 		 515 aa  296  5e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  39.61 
 
 		 863 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  39.53 
 
 		 507 aa  296  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  37.38 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  38.48 
 
 		 522 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  41.92 
 
 		 575 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  35.94 
 
 		 534 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  42.32 
 
 		 545 aa  293  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  36.79 
 
 		 528 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 		 547 aa  292  9e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  40.95 
 
 		 867 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  38.42 
 
 		 577 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  46.52 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  40.5 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  45.21 
 
 		 507 aa  286  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  36.38 
 
 		 533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  38.65 
 
 		 557 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 		 598 aa  282  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  41.1 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  38.82 
 
 		 847 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  34.5 
 
 		 531 aa  281  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  35.7 
 
 		 519 aa  279  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  41.14 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  35.48 
 
 		 531 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  33.98 
 
 		 531 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  34.55 
 
 		 531 aa  276  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  36.33 
 
 		 516 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  34.52 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  34.52 
 
 		 509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  37.41 
 
 		 557 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  34.52 
 
 		 509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  37.41 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  34.72 
 
 		 509 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0087  L-aspartate oxidase  42.32 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  35.22 
 
 		 571 aa  272  9e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  36.51 
 
 		 556 aa  272  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  37.62 
 
 		 538 aa  272  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  34.63 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4715  L-aspartate oxidase  40.2 
 
 		 572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232267  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  34.13 
 
 		 509 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  33.86 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  33.8 
 
 		 509 aa  270  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  38.34 
 
 		 609 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  37.8 
 
 		 538 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  37.8 
 
 		 538 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  36.61 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  33.07 
 
 		 528 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  37.76 
 
 		 543 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  34.7 
 
 		 537 aa  267  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  36.38 
 
 		 518 aa  266  7e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  35.32 
 
 		 555 aa  266  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  33.4 
 
 		 509 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  36.1 
 
 		 533 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  37.84 
 
 		 533 aa  266  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  32.88 
 
 		 511 aa  266  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  36.38 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  35.37 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0686  L-aspartate oxidase  33.72 
 
 		 527 aa  264  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.28562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  34.43 
 
 		 565 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  36.25 
 
 		 556 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  36.7 
 
 		 533 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  36.7 
 
 		 533 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4515  L-aspartate oxidase  34.52 
 
 		 509 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  35.12 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>