More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0686 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0686  L-aspartate oxidase  100 
 
 
527 aa  1102    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.28562  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1373  L-aspartate oxidase  64.71 
 
 
527 aa  709    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588403  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1829  L-aspartate oxidase  60.67 
 
 
534 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0426262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0526  L-aspartate oxidase  61.71 
 
 
530 aa  672    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.761934 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1351  L-aspartate oxidase  60.3 
 
 
528 aa  663    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35363  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0806  L-aspartate oxidase  54.61 
 
 
541 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0437  L-aspartate oxidase  45.67 
 
 
534 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1003  L-aspartate oxidase  45.47 
 
 
534 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  43.51 
 
 
534 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  43.86 
 
 
533 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 
533 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  43.98 
 
 
525 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  43.54 
 
 
528 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0330  L-aspartate oxidase  44.04 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  42.61 
 
 
538 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  42.61 
 
 
538 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0787  L-aspartate oxidase  44.51 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.481111  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
535 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  43.1 
 
 
533 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  41.75 
 
 
538 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  43.16 
 
 
533 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  41.67 
 
 
536 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  41.05 
 
 
538 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  40.79 
 
 
538 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 
537 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  43.38 
 
 
530 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 
534 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  44.06 
 
 
532 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  41.24 
 
 
535 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  42.67 
 
 
533 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  41.05 
 
 
534 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  40.68 
 
 
538 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  41.09 
 
 
541 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  41.67 
 
 
537 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  41.05 
 
 
534 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  40.95 
 
 
531 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  41.37 
 
 
537 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  41.37 
 
 
537 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  41.7 
 
 
538 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  40.99 
 
 
538 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  41.86 
 
 
570 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  41.24 
 
 
560 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  41.86 
 
 
570 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  40.8 
 
 
532 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  41.9 
 
 
535 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 
536 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  41.89 
 
 
537 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  41.09 
 
 
563 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  41.89 
 
 
537 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 
533 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 
536 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 
534 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 
533 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  43.13 
 
 
546 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  41.86 
 
 
570 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  41.89 
 
 
537 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  41.86 
 
 
570 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  42.08 
 
 
537 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 
539 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  41.37 
 
 
537 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 
532 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  41.22 
 
 
531 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  42.13 
 
 
535 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  40.53 
 
 
543 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  41.89 
 
 
537 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  41.18 
 
 
542 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  40.76 
 
 
531 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  41.86 
 
 
570 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 
537 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  41.48 
 
 
537 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  40.68 
 
 
561 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  40.83 
 
 
533 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  41.11 
 
 
531 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 
532 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  41.18 
 
 
550 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  41.78 
 
 
531 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  41.02 
 
 
533 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 
532 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  41.15 
 
 
542 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  41.19 
 
 
540 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  40.92 
 
 
545 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 
528 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  40.95 
 
 
531 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  40.53 
 
 
552 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 
540 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 
540 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2315  L-aspartate oxidase  42.61 
 
 
528 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  40.99 
 
 
539 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  41.6 
 
 
540 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 
540 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 
552 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 
540 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 
529 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  41 
 
 
540 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  41 
 
 
540 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 
538 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  41.56 
 
 
535 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  41.76 
 
 
532 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 
536 aa  379  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  40.66 
 
 
541 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>