More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1182 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  100 
 
 
513 aa  966    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  60 
 
 
519 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  61.23 
 
 
517 aa  551  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  62.82 
 
 
513 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  62.12 
 
 
522 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  60.08 
 
 
517 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  56.56 
 
 
512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  56.35 
 
 
512 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  55.11 
 
 
516 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  56.83 
 
 
506 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 
509 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  58.51 
 
 
506 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  56.53 
 
 
502 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55 
 
 
499 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  55.23 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  54.76 
 
 
509 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  55.53 
 
 
509 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  48.22 
 
 
537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  51.42 
 
 
518 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  49.22 
 
 
534 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  54.22 
 
 
500 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  51.17 
 
 
540 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  49.9 
 
 
539 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  50.78 
 
 
538 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  54.41 
 
 
501 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  51.23 
 
 
532 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  44.25 
 
 
532 aa  365  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  54.89 
 
 
507 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  46.34 
 
 
531 aa  358  9e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  39.13 
 
 
535 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  43.72 
 
 
522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  45.85 
 
 
521 aa  336  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  43.66 
 
 
543 aa  335  7.999999999999999e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  38 
 
 
519 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  46.63 
 
 
867 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  41.41 
 
 
515 aa  330  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  41.9 
 
 
515 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  37.3 
 
 
538 aa  325  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  37.2 
 
 
509 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  37.35 
 
 
532 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 
507 aa  320  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  40.93 
 
 
541 aa  319  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  36.73 
 
 
509 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  36.8 
 
 
509 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  39.03 
 
 
516 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  35.97 
 
 
509 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  37.92 
 
 
542 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  37.01 
 
 
511 aa  318  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  37.47 
 
 
509 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  36.61 
 
 
509 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  36.71 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  36.71 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  50.99 
 
 
598 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  44.51 
 
 
575 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  46.61 
 
 
545 aa  312  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  50.47 
 
 
566 aa  312  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  40.59 
 
 
529 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  49.6 
 
 
506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  34.89 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  37.19 
 
 
555 aa  306  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  46.25 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  36.91 
 
 
534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  46.25 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4515  L-aspartate oxidase  37.15 
 
 
509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  36.42 
 
 
555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  44.95 
 
 
847 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  36.42 
 
 
555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  46.04 
 
 
535 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2362  L-aspartate oxidase  45.13 
 
 
532 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  44.62 
 
 
863 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  39.16 
 
 
528 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  40.73 
 
 
550 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01121  L-aspartate oxidase  36.45 
 
 
555 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.517709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  42.63 
 
 
557 aa  300  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  39.11 
 
 
571 aa  299  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  45.83 
 
 
548 aa  298  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  39.88 
 
 
513 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1263  L-aspartate oxidase (quinolinate synthetase B) oxidoreductase protein  41.45 
 
 
536 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  44.08 
 
 
577 aa  297  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3145  L-aspartate oxidase  36.57 
 
 
502 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0480414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.43 
 
 
532 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  39.48 
 
 
545 aa  296  8e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  44.12 
 
 
572 aa  296  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  46.26 
 
 
872 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  40 
 
 
557 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  40 
 
 
558 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2477  L-aspartate oxidase  45.1 
 
 
503 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  39.21 
 
 
556 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  44.6 
 
 
558 aa  291  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  37.48 
 
 
556 aa  289  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  40.4 
 
 
538 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  39.17 
 
 
533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  44.55 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  43.74 
 
 
576 aa  287  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  38.72 
 
 
483 aa  286  4e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  46.23 
 
 
519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4056  L-aspartate oxidase  37.65 
 
 
507 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.916074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11611  L-aspartate oxidase  44.74 
 
 
527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03760  L-aspartate oxidase  55.15 
 
 
534 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  45.93 
 
 
565 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>