More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1263 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1263  L-aspartate oxidase (quinolinate synthetase B) oxidoreductase protein  100 
 
 		 536 aa  1100    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  45.22 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  45.03 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  43.73 
 
 		 532 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  43.73 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  43.53 
 
 		 532 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  44.9 
 
 		 533 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 535 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  44.21 
 
 		 528 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 570 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 533 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  43.14 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 570 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 533 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  43.86 
 
 		 535 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 570 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 570 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 570 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  44.42 
 
 		 523 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  43.83 
 
 		 541 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  43.5 
 
 		 543 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  43.14 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  43.14 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  43.81 
 
 		 529 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  43.14 
 
 		 528 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  43.36 
 
 		 525 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  43.14 
 
 		 528 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  43.14 
 
 		 528 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2849  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 		 535 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  41.32 
 
 		 539 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  42.96 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 529 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  43.54 
 
 		 546 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  40.95 
 
 		 552 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  41.95 
 
 		 534 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  43.17 
 
 		 530 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 		 534 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1965  L-aspartate oxidase  40.88 
 
 		 623 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  41.31 
 
 		 538 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  42.35 
 
 		 528 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  43.13 
 
 		 533 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 		 534 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  43.13 
 
 		 533 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  43.13 
 
 		 545 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  41.75 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 540 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 540 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  40.34 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 		 533 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  41.52 
 
 		 552 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 		 533 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  42.47 
 
 		 538 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  42.02 
 
 		 538 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  40.57 
 
 		 537 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  40.34 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  42.61 
 
 		 536 aa  389  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  43.66 
 
 		 540 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  42.24 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  43.84 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  43.47 
 
 		 540 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  40.34 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  40.34 
 
 		 537 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  41.57 
 
 		 535 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 		 537 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2149  L-aspartate oxidase  45.12 
 
 		 499 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  40.49 
 
 		 543 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  40.08 
 
 		 537 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  41.12 
 
 		 538 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  43.27 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 		 563 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 		 537 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  43.36 
 
 		 530 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 		 537 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  40.64 
 
 		 536 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  41.51 
 
 		 534 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  39.96 
 
 		 537 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  42.31 
 
 		 538 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  42.78 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  41.25 
 
 		 536 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  40.27 
 
 		 532 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 		 550 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  42.02 
 
 		 533 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  40.85 
 
 		 561 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  41.31 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  42.03 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  43.81 
 
 		 528 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  42.66 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  41.36 
 
 		 542 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  41.06 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  40.23 
 
 		 538 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  41.21 
 
 		 536 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  41.41 
 
 		 544 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>