More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1965 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1965  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 623 aa  1275    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0631  L-aspartate oxidase  56.33 
 
 		 629 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0599  L-aspartate oxidase  56.51 
 
 		 635 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  46.47 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 		 533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 		 570 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 		 538 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 		 538 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  45.54 
 
 		 534 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  45.99 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  44.63 
 
 		 528 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  45.55 
 
 		 532 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  45.71 
 
 		 534 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  45.69 
 
 		 546 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  45.36 
 
 		 532 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  45.36 
 
 		 532 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  43.66 
 
 		 532 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  45.8 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  46.73 
 
 		 533 aa  435  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  44.48 
 
 		 538 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  44.89 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  45.65 
 
 		 533 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  44.89 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  45.11 
 
 		 538 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  44.89 
 
 		 528 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  44.89 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  44.89 
 
 		 528 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  42.78 
 
 		 536 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  44.11 
 
 		 538 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  43.32 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  45.11 
 
 		 533 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  44.46 
 
 		 537 aa  432  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  45.31 
 
 		 538 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  44.46 
 
 		 528 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  43.93 
 
 		 537 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  44.93 
 
 		 538 aa  428  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  43.46 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  45.14 
 
 		 538 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  43.39 
 
 		 534 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  43.93 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  44.83 
 
 		 543 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  43.15 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  43.93 
 
 		 537 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  43.62 
 
 		 535 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  43.93 
 
 		 537 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  43.11 
 
 		 537 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  43.84 
 
 		 528 aa  425  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  45.19 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  44.48 
 
 		 523 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  43.24 
 
 		 539 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  42.98 
 
 		 537 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  43.21 
 
 		 538 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  45.19 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  43.16 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  42.38 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  42.12 
 
 		 539 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  43.65 
 
 		 536 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  42.98 
 
 		 537 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  43.33 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  43.82 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  42.58 
 
 		 531 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  42.73 
 
 		 537 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  43.62 
 
 		 534 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  43.65 
 
 		 550 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  46.14 
 
 		 544 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  42.15 
 
 		 535 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  41.81 
 
 		 532 aa  415  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 539 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  42.81 
 
 		 533 aa  415  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2149  L-aspartate oxidase  47.37 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  43.3 
 
 		 529 aa  415  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  41.8 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  41.58 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  41.98 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  42.81 
 
 		 545 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 		 540 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  41.58 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  42.81 
 
 		 533 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  44.2 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  42.81 
 
 		 533 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  41.93 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  41.85 
 
 		 533 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  42.43 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  42.44 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  42.56 
 
 		 541 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  42.81 
 
 		 541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  41.8 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  41.62 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  40.98 
 
 		 539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  41.8 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  41.58 
 
 		 540 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  41.85 
 
 		 533 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>