More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1927 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  59.63 
 
 
537 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  62.66 
 
 
534 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  61.77 
 
 
533 aa  638    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  61.21 
 
 
533 aa  635    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  59.25 
 
 
536 aa  648    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  59.44 
 
 
536 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  58.69 
 
 
532 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  59.07 
 
 
537 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  61.27 
 
 
538 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  59.07 
 
 
538 aa  634    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  62.66 
 
 
534 aa  675    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  58.13 
 
 
537 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  61.27 
 
 
538 aa  673    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  61.16 
 
 
534 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  60.08 
 
 
525 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  61.28 
 
 
542 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 
537 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 
537 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  61.02 
 
 
528 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  62.29 
 
 
535 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  58.57 
 
 
539 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  61.54 
 
 
538 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  63.3 
 
 
529 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  60.8 
 
 
532 aa  643    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  60.52 
 
 
539 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  59.77 
 
 
550 aa  648    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  60.37 
 
 
534 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  58.88 
 
 
537 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 
537 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  73.35 
 
 
532 aa  777    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  59.09 
 
 
555 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  61.05 
 
 
541 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  61.44 
 
 
538 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  59.47 
 
 
537 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  60.64 
 
 
535 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  63.23 
 
 
542 aa  659    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2315  L-aspartate oxidase  74.1 
 
 
528 aa  801    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  61.48 
 
 
543 aa  670    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  58.69 
 
 
536 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  58.69 
 
 
537 aa  646    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  58.69 
 
 
537 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  59.44 
 
 
538 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  60.59 
 
 
538 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  61.39 
 
 
533 aa  634    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  61.15 
 
 
538 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  63.3 
 
 
529 aa  643    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  58.32 
 
 
537 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  100 
 
 
531 aa  1082    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  59.81 
 
 
535 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  61.13 
 
 
535 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  59.22 
 
 
534 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  61.13 
 
 
570 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  61.36 
 
 
533 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  61.21 
 
 
528 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  61.13 
 
 
570 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  62.57 
 
 
523 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  58.57 
 
 
533 aa  633  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  61.13 
 
 
570 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  58.95 
 
 
545 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  61.13 
 
 
570 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  58.95 
 
 
533 aa  633  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  61.39 
 
 
533 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  61.13 
 
 
570 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  58.83 
 
 
545 aa  633  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  58.95 
 
 
533 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  58.96 
 
 
540 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  59.33 
 
 
540 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  58.38 
 
 
533 aa  631  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  60.94 
 
 
532 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1097  L-aspartate oxidase  58.69 
 
 
531 aa  631  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.565133  normal  0.0527143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  62.48 
 
 
544 aa  629  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  58.96 
 
 
540 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  60.08 
 
 
541 aa  628  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  60.91 
 
 
532 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  58.96 
 
 
540 aa  628  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  60.98 
 
 
533 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  58.77 
 
 
540 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  59.36 
 
 
538 aa  628  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  59.36 
 
 
538 aa  628  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  58.96 
 
 
540 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  58.96 
 
 
540 aa  626  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  60.45 
 
 
532 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  58.99 
 
 
539 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  57.17 
 
 
561 aa  622  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  58.98 
 
 
530 aa  618  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002490  L-aspartate oxidase  59.21 
 
 
561 aa  618  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79354  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  60.83 
 
 
528 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  60.83 
 
 
528 aa  618  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  60.83 
 
 
528 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  60.64 
 
 
528 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  60.98 
 
 
525 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  60.83 
 
 
528 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  60.64 
 
 
528 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  58.24 
 
 
539 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  60.34 
 
 
530 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  55.64 
 
 
543 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03543  L-aspartate oxidase  58.08 
 
 
559 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  57.68 
 
 
540 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  58.05 
 
 
540 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  57.87 
 
 
540 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>