More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2149 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2149  L-aspartate oxidase  100 
 
 
499 aa  981    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  53.54 
 
 
532 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  53.94 
 
 
528 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  53.63 
 
 
532 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  53.54 
 
 
533 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 
535 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  52.64 
 
 
533 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  53.23 
 
 
528 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  51.97 
 
 
533 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 
570 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 
570 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 
570 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  53.35 
 
 
532 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 
570 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  52.43 
 
 
570 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  52.36 
 
 
533 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  53.35 
 
 
535 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  52.05 
 
 
533 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  53.33 
 
 
528 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  53.33 
 
 
528 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  52.94 
 
 
528 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  50.87 
 
 
552 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  50.19 
 
 
534 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  52.94 
 
 
528 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  52.94 
 
 
528 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  52.91 
 
 
523 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  50.69 
 
 
538 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  50.69 
 
 
538 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  52.95 
 
 
528 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  52.47 
 
 
532 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  51.07 
 
 
552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  51.94 
 
 
535 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  51.06 
 
 
541 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  51.06 
 
 
534 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  48.84 
 
 
538 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  50.78 
 
 
534 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  51.26 
 
 
534 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  49.61 
 
 
538 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  49.8 
 
 
525 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  50.88 
 
 
543 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  49.22 
 
 
538 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  48.53 
 
 
542 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  49.61 
 
 
538 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  52.23 
 
 
529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  48.26 
 
 
538 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  49.03 
 
 
538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  47.49 
 
 
537 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  50.3 
 
 
530 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  53.56 
 
 
529 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1965  L-aspartate oxidase  47.55 
 
 
623 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  50.78 
 
 
546 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  51.87 
 
 
525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  51.86 
 
 
536 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  47.67 
 
 
536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  46.9 
 
 
543 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  50.49 
 
 
541 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  48 
 
 
560 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  51.74 
 
 
529 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  48.43 
 
 
542 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  45.87 
 
 
532 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  46.72 
 
 
536 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  47.83 
 
 
539 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  46.91 
 
 
537 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  46.91 
 
 
537 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  46.91 
 
 
537 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  48.92 
 
 
541 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  46.62 
 
 
538 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  47.06 
 
 
555 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  46.69 
 
 
536 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  46.88 
 
 
535 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  46.89 
 
 
537 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  47.66 
 
 
536 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  48.44 
 
 
534 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  46.3 
 
 
537 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  47.66 
 
 
536 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  47.41 
 
 
539 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  47.75 
 
 
533 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  46.73 
 
 
533 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  46.73 
 
 
533 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2849  L-aspartate oxidase  45.92 
 
 
535 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  50 
 
 
544 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  45.86 
 
 
538 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  52.27 
 
 
528 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  46.65 
 
 
540 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  47.13 
 
 
531 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  47.18 
 
 
540 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  46.55 
 
 
540 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  46.55 
 
 
540 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  46.3 
 
 
537 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  46.36 
 
 
539 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 
561 aa  428  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  45.87 
 
 
533 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 
537 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  45.87 
 
 
545 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  45.87 
 
 
533 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  46.55 
 
 
540 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 
537 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  49.42 
 
 
563 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 
537 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 
537 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>