More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03760 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03760  L-aspartate oxidase  100 
 
 
534 aa  1016    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347545  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  49.53 
 
 
543 aa  429  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  47.88 
 
 
529 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  51.89 
 
 
576 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2775  L-aspartate oxidase  57.43 
 
 
519 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  46.62 
 
 
515 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  45.63 
 
 
515 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 
542 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  48.83 
 
 
507 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  41.62 
 
 
532 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  46.48 
 
 
522 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  47.17 
 
 
541 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2296  L-aspartate oxidase  49.38 
 
 
550 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000882824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  53.07 
 
 
598 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  43.55 
 
 
571 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  48.89 
 
 
867 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  44.32 
 
 
535 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  48.61 
 
 
577 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2375  L-aspartate oxidase  44.79 
 
 
559 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  44.32 
 
 
535 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  44.13 
 
 
535 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  43.51 
 
 
565 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2559  L-aspartate oxidase  48.6 
 
 
591 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.617857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  44.7 
 
 
533 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.3 
 
 
535 aa  364  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 
556 aa  364  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  42.99 
 
 
533 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  42.72 
 
 
532 aa  363  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  52.12 
 
 
545 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3558  L-aspartate oxidase  55.62 
 
 
528 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0431464  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  43.63 
 
 
558 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  43.63 
 
 
557 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  49.61 
 
 
847 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  42.86 
 
 
528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  42.65 
 
 
534 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  46.54 
 
 
534 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  46.76 
 
 
863 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  45.6 
 
 
538 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  39.69 
 
 
531 aa  353  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  41.19 
 
 
532 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  41.18 
 
 
536 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.35 
 
 
531 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  41.39 
 
 
537 aa  351  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  49.07 
 
 
556 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  39.3 
 
 
538 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  39.27 
 
 
519 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  43.33 
 
 
528 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 
531 aa  350  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  40.3 
 
 
540 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  39.45 
 
 
534 aa  350  4e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
539 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  39.89 
 
 
533 aa  348  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
540 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
540 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  38.83 
 
 
509 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  40.77 
 
 
536 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  44.24 
 
 
609 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
540 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  38.83 
 
 
509 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  43.31 
 
 
535 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  40.07 
 
 
533 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  39.53 
 
 
509 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 
537 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  40.4 
 
 
538 aa  348  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 
537 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  40.59 
 
 
536 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  38.64 
 
 
509 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  38.45 
 
 
509 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  40.42 
 
 
540 aa  346  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 
509 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  39.42 
 
 
537 aa  346  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  38.83 
 
 
509 aa  346  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  40.66 
 
 
537 aa  346  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  40.14 
 
 
535 aa  346  8e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  40.19 
 
 
531 aa  345  8.999999999999999e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  38.64 
 
 
509 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  40.46 
 
 
539 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  40.42 
 
 
540 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  45.54 
 
 
529 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  44.02 
 
 
541 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  42.96 
 
 
528 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  42.13 
 
 
541 aa  344  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  42.19 
 
 
528 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  42.04 
 
 
552 aa  345  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  40.38 
 
 
539 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  42.96 
 
 
528 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  40.42 
 
 
540 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  39.74 
 
 
532 aa  344  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  40.27 
 
 
531 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  40.11 
 
 
537 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  49.34 
 
 
558 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  40.61 
 
 
540 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  39.5 
 
 
531 aa  343  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  44.42 
 
 
535 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  39.75 
 
 
537 aa  343  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  44.65 
 
 
523 aa  343  5e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  40.42 
 
 
540 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  40.15 
 
 
540 aa  342  7e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  39.27 
 
 
537 aa  342  8e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2374  L-aspartate oxidase  42.43 
 
 
558 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>