More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3558 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3558  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 528 aa  1000    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0431464  normal  0.0713532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  52.22 
 
 		 576 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2775  L-aspartate oxidase  56.8 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  44.91 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  44.51 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  42.28 
 
 		 532 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  49.41 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  45.32 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  44.53 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  46 
 
 		 543 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  40.42 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03760  L-aspartate oxidase  55.16 
 
 		 534 aa  364  2e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347545  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  45.14 
 
 		 529 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  45.14 
 
 		 529 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2296  L-aspartate oxidase  47.92 
 
 		 550 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000882824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  48.6 
 
 		 867 aa  353  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  39.2 
 
 		 534 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 532 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  46.59 
 
 		 538 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  47.26 
 
 		 863 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  40.42 
 
 		 531 aa  349  9e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  43.41 
 
 		 556 aa  348  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  50.49 
 
 		 548 aa  348  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2559  L-aspartate oxidase  52.87 
 
 		 591 aa  347  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.617857  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  49.06 
 
 		 545 aa  346  7e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  43.46 
 
 		 533 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  45.25 
 
 		 541 aa  345  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  45.51 
 
 		 522 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  48.75 
 
 		 847 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  48.06 
 
 		 598 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  48.58 
 
 		 577 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  47.29 
 
 		 557 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  39.62 
 
 		 537 aa  342  9e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  45.52 
 
 		 529 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  39.85 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  41.84 
 
 		 571 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  38.2 
 
 		 531 aa  340  5e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  38.74 
 
 		 531 aa  340  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  41.55 
 
 		 538 aa  339  7e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  41.55 
 
 		 538 aa  339  7e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  39.77 
 
 		 531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  43.74 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  48.11 
 
 		 572 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  40.46 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  40.36 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  38.37 
 
 		 531 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  40.68 
 
 		 541 aa  334  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  40.28 
 
 		 509 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  44.25 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  40.16 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  39.29 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  47.68 
 
 		 566 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  39.53 
 
 		 509 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  40.86 
 
 		 579 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  40.16 
 
 		 509 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  38.59 
 
 		 538 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  41.92 
 
 		 532 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  39.96 
 
 		 509 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  39.96 
 
 		 509 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  42.08 
 
 		 532 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  42.07 
 
 		 528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  42 
 
 		 533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  42.02 
 
 		 528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  40.6 
 
 		 536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  41.08 
 
 		 534 aa  327  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  39.29 
 
 		 519 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  40.58 
 
 		 565 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  44.11 
 
 		 550 aa  327  4.0000000000000003e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  42 
 
 		 533 aa  326  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  41.92 
 
 		 532 aa  326  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  41.49 
 
 		 531 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  41.56 
 
 		 535 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  47.65 
 
 		 575 aa  325  9e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  40.45 
 
 		 531 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  38.81 
 
 		 538 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  41.65 
 
 		 557 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  42.1 
 
 		 535 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  43.71 
 
 		 529 aa  324  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  39.51 
 
 		 537 aa  323  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  41.9 
 
 		 535 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  42.97 
 
 		 563 aa  323  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01131  L-aspartate oxidase  40.34 
 
 		 562 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  41.59 
 
 		 545 aa  323  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 		 548 aa  323  6e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 		 548 aa  323  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  44.4 
 
 		 535 aa  323  7e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  47.88 
 
 		 558 aa  322  8e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  41.87 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  47.16 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  50 
 
 		 538 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  40.63 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  45.14 
 
 		 516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  40.59 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 570 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 535 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 570 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 570 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 570 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  42.42 
 
 		 570 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>