More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1542 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1542  L-aspartate oxidase  100 
 
 
501 aa  942    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.330022  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3493  L-aspartate oxidase  55.6 
 
 
522 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356511  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2820  L-aspartate oxidase  53.48 
 
 
506 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2556  L-aspartate oxidase  53.32 
 
 
517 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  53.27 
 
 
517 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  52.82 
 
 
519 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  51.11 
 
 
516 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1428  L-aspartate oxidase  54.87 
 
 
518 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2425  L-aspartate oxidase  53.43 
 
 
509 aa  398  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  53.02 
 
 
502 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  47.99 
 
 
512 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7189  L-aspartate oxidase  52.75 
 
 
513 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.901371  normal  0.0177841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0296  L-aspartate oxidase  53.29 
 
 
506 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  51.5 
 
 
509 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1182  L-aspartate oxidase  54.02 
 
 
513 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1044  L-aspartate oxidase  47.79 
 
 
512 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.938369  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2768  L-aspartate oxidase  52.42 
 
 
509 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0169  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.02 
 
 
499 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  51.14 
 
 
509 aa  361  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  53.09 
 
 
500 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  47.98 
 
 
537 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1106  L-aspartate oxidase  47.57 
 
 
540 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1228  L-aspartate oxidase  49.17 
 
 
539 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 
534 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  43.16 
 
 
532 aa  340  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1246  L-aspartate oxidase  46.37 
 
 
538 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5464  L-aspartate oxidase  52.59 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1433  L-aspartate oxidase  45.24 
 
 
532 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  38.95 
 
 
532 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4309  L-aspartate oxidase  50.31 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0790  L-aspartate oxidase  44.83 
 
 
547 aa  302  9e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0247057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  39.36 
 
 
535 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  40.04 
 
 
556 aa  297  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4431  L-aspartate oxidase  45.44 
 
 
521 aa  297  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  41.1 
 
 
483 aa  295  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  44.62 
 
 
847 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  38.08 
 
 
542 aa  294  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.55 
 
 
532 aa  293  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.1 
 
 
472 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  44.38 
 
 
548 aa  292  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  35.41 
 
 
555 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  34.72 
 
 
555 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  37.79 
 
 
565 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  45.04 
 
 
545 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  39.89 
 
 
556 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  35.41 
 
 
555 aa  286  9e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  41.16 
 
 
529 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  35.33 
 
 
525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  39.61 
 
 
545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2249  L-aspartate oxidase  43.15 
 
 
531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  41.57 
 
 
515 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  41.24 
 
 
522 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  36.82 
 
 
519 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  38.22 
 
 
533 aa  282  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  44.27 
 
 
575 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  36.46 
 
 
509 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  36.46 
 
 
509 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  36.46 
 
 
509 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2477  L-aspartate oxidase  47.74 
 
 
503 aa  281  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  41.76 
 
 
863 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  36.23 
 
 
509 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  42.88 
 
 
867 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  39.49 
 
 
538 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  39.49 
 
 
538 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  38.51 
 
 
538 aa  280  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  36.73 
 
 
509 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  35.83 
 
 
509 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  35.63 
 
 
509 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  40.93 
 
 
543 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  36.53 
 
 
509 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  45.9 
 
 
556 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  38.16 
 
 
571 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  40.55 
 
 
532 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  46.86 
 
 
598 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  40.16 
 
 
533 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  47.07 
 
 
548 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  47.07 
 
 
548 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  40.24 
 
 
530 aa  277  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  40.16 
 
 
533 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  41.05 
 
 
535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  40.35 
 
 
533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  38.76 
 
 
525 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01121  L-aspartate oxidase  35.21 
 
 
555 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.517709  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  41.05 
 
 
515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  47.07 
 
 
535 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0917  L-aspartate oxidase  38.37 
 
 
513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  36.99 
 
 
534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  38.76 
 
 
541 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1965  L-aspartate oxidase  38.93 
 
 
623 aa  274  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  43.98 
 
 
558 aa  273  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  36.42 
 
 
531 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  41.25 
 
 
577 aa  272  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  40.43 
 
 
532 aa  272  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  39.18 
 
 
528 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  35.01 
 
 
511 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  40.71 
 
 
532 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  39.88 
 
 
528 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  38.53 
 
 
550 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  36.59 
 
 
516 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  35.73 
 
 
566 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>