More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4589 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4589  L-aspartate oxidase  100 
 
 
549 aa  1106    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3933  L-aspartate oxidase  66.6 
 
 
544 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4301  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  85.79 
 
 
549 aa  917    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346412  decreased coverage  0.00817014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2911  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  47.78 
 
 
531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0644438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2665  L-aspartate oxidase  47.12 
 
 
538 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1249  L-aspartate oxidase  48.4 
 
 
532 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00428614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  44.49 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1746  L-aspartate oxidase  46.95 
 
 
553 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0359487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0982  L-aspartate oxidase  43.81 
 
 
565 aa  375  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000258616  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.25 
 
 
542 aa  243  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.81 
 
 
589 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.92 
 
 
543 aa  230  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.86 
 
 
552 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.4 
 
 
644 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.04 
 
 
638 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.11 
 
 
542 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.87 
 
 
608 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  39.35 
 
 
528 aa  224  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  38.23 
 
 
609 aa  223  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.87 
 
 
546 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.86 
 
 
562 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  37.38 
 
 
533 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  38.79 
 
 
527 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.3 
 
 
646 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.84 
 
 
539 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.58 
 
 
623 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.02 
 
 
532 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.31 
 
 
644 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.25 
 
 
646 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.02 
 
 
648 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.02 
 
 
648 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.18 
 
 
648 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.84 
 
 
539 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  36.41 
 
 
539 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.33 
 
 
621 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  37.95 
 
 
535 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.09 
 
 
563 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  36.75 
 
 
646 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.99 
 
 
539 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  35.44 
 
 
568 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  35.17 
 
 
584 aa  211  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  36.3 
 
 
535 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  36.69 
 
 
576 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  36.08 
 
 
535 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.1 
 
 
540 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  32.97 
 
 
534 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  34.12 
 
 
555 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  37.1 
 
 
546 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.87 
 
 
627 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  38.65 
 
 
529 aa  206  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.11 
 
 
570 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  36.3 
 
 
531 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  36.07 
 
 
531 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  38.5 
 
 
558 aa  204  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 
545 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  35.73 
 
 
542 aa  203  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  34.48 
 
 
532 aa  203  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.76 
 
 
598 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  36.88 
 
 
531 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  34.69 
 
 
579 aa  201  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  37.04 
 
 
541 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  35.75 
 
 
565 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  36.49 
 
 
543 aa  200  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  38.96 
 
 
598 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  36.47 
 
 
534 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  38.77 
 
 
507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  33.18 
 
 
528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  34.58 
 
 
543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  33.88 
 
 
601 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  36.5 
 
 
515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  33.88 
 
 
601 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  36.58 
 
 
532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  36.67 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  36.91 
 
 
535 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  34.31 
 
 
539 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  35.86 
 
 
525 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  36.81 
 
 
598 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  34.74 
 
 
532 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.06 
 
 
542 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  33.73 
 
 
532 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.13 
 
 
616 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  34.33 
 
 
531 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  35.07 
 
 
531 aa  196  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  35.49 
 
 
531 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.27 
 
 
601 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  35.24 
 
 
534 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  33.57 
 
 
596 aa  196  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.1 
 
 
602 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  36.72 
 
 
598 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  33.49 
 
 
534 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2374  L-aspartate oxidase  35.39 
 
 
558 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  34.79 
 
 
538 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.9 
 
 
616 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  36.01 
 
 
525 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  33.71 
 
 
550 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  32.94 
 
 
601 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4056  L-aspartate oxidase  31.16 
 
 
507 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.916074  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.18 
 
 
591 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.18 
 
 
591 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  36.94 
 
 
575 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>