More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4301 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4589  L-aspartate oxidase  85.79 
 
 		 549 aa  904    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3933  L-aspartate oxidase  65.65 
 
 		 544 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4301  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  100 
 
 		 549 aa  1100    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346412  decreased coverage  0.00817014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2911  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  49.21 
 
 		 531 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0644438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2665  L-aspartate oxidase  47.4 
 
 		 538 aa  432  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1249  L-aspartate oxidase  46.56 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00428614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  46.02 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1746  L-aspartate oxidase  45.94 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0982  L-aspartate oxidase  43.92 
 
 		 565 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000258616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.67 
 
 		 589 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.81 
 
 		 542 aa  244  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  40 
 
 		 527 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 		 638 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.56 
 
 		 543 aa  227  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.38 
 
 		 644 aa  226  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  38.66 
 
 		 609 aa  226  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.71 
 
 		 646 aa  223  9e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  39.46 
 
 		 528 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.03 
 
 		 552 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.74 
 
 		 646 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  38.05 
 
 		 533 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.9 
 
 		 542 aa  219  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.5 
 
 		 608 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  38.37 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.9 
 
 		 562 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.35 
 
 		 540 aa  216  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.56 
 
 		 644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.69 
 
 		 648 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.69 
 
 		 648 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.69 
 
 		 648 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  35.58 
 
 		 584 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  37.14 
 
 		 533 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  36.87 
 
 		 646 aa  213  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.03 
 
 		 623 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  36.84 
 
 		 531 aa  210  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.44 
 
 		 621 aa  210  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  37.64 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.18 
 
 		 539 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.07 
 
 		 627 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  37.59 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  36.5 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  35.9 
 
 		 539 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.68 
 
 		 570 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  34.83 
 
 		 601 aa  207  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.83 
 
 		 601 aa  207  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  34.7 
 
 		 579 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.6 
 
 		 546 aa  207  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  35.76 
 
 		 532 aa  207  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.33 
 
 		 616 aa  206  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  35.55 
 
 		 531 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  37.53 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.17 
 
 		 588 aa  206  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.11 
 
 		 616 aa  204  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.36 
 
 		 601 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.09 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  37.29 
 
 		 535 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  38.15 
 
 		 558 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.78 
 
 		 598 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  36.17 
 
 		 576 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  36.63 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  34.1 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.62 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  37.84 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  37.14 
 
 		 529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  39.33 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  36.95 
 
 		 598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.66 
 
 		 601 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  34.03 
 
 		 596 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  35.84 
 
 		 539 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  35.28 
 
 		 534 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  35.56 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.06 
 
 		 539 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  34.45 
 
 		 560 aa  200  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  34.11 
 
 		 598 aa  200  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  39.22 
 
 		 598 aa  200  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  35.92 
 
 		 582 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  33.26 
 
 		 534 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.41 
 
 		 602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  36.39 
 
 		 525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.32 
 
 		 563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  34.09 
 
 		 550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.64 
 
 		 592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  34.86 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  34.93 
 
 		 534 aa  199  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  33.26 
 
 		 602 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  37.62 
 
 		 529 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.72 
 
 		 591 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.72 
 
 		 591 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.72 
 
 		 591 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  36.19 
 
 		 546 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.72 
 
 		 591 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.72 
 
 		 591 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  33.64 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.97 
 
 		 592 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.26 
 
 		 591 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.26 
 
 		 591 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.73 
 
 		 592 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.73 
 
 		 592 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.73 
 
 		 592 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.73 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>