More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1746 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1746  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 553 aa  1124    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  53.33 
 
 		 555 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2665  L-aspartate oxidase  52.32 
 
 		 538 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1249  L-aspartate oxidase  53.12 
 
 		 532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00428614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0982  L-aspartate oxidase  50.27 
 
 		 565 aa  508  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000258616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2911  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  45.72 
 
 		 531 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0644438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3933  L-aspartate oxidase  46.88 
 
 		 544 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4589  L-aspartate oxidase  46.84 
 
 		 549 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4301  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  45.94 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0346412  decreased coverage  0.00817014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.95 
 
 		 562 aa  250  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39 
 
 		 589 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.1 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  39.13 
 
 		 576 aa  236  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.77 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.67 
 
 		 638 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.03 
 
 		 542 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.48 
 
 		 646 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.25 
 
 		 543 aa  228  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.73 
 
 		 644 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.95 
 
 		 608 aa  224  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.5 
 
 		 644 aa  223  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  39.4 
 
 		 609 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.92 
 
 		 648 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.92 
 
 		 648 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.92 
 
 		 648 aa  220  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.54 
 
 		 563 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.54 
 
 		 627 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  35.77 
 
 		 542 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  35.96 
 
 		 576 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  33.94 
 
 		 584 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.25 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  37.92 
 
 		 646 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  35.45 
 
 		 568 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.78 
 
 		 552 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  35.38 
 
 		 582 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  35.5 
 
 		 533 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.64 
 
 		 646 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  36.36 
 
 		 598 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  35.94 
 
 		 545 aa  210  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.97 
 
 		 623 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4056  L-aspartate oxidase  34.22 
 
 		 507 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.916074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  37.68 
 
 		 545 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 		 539 aa  207  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  36.88 
 
 		 522 aa  207  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.5 
 
 		 579 aa  207  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  35.34 
 
 		 574 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  34.16 
 
 		 534 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  34.33 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.35 
 
 		 601 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.37 
 
 		 539 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  37.38 
 
 		 541 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  36.07 
 
 		 863 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  33.56 
 
 		 596 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.06 
 
 		 546 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  36.25 
 
 		 575 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.52 
 
 		 575 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  34.74 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.51 
 
 		 575 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  34.27 
 
 		 596 aa  200  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.21 
 
 		 539 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.11 
 
 		 601 aa  200  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  34.67 
 
 		 539 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  34.73 
 
 		 867 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  34.29 
 
 		 532 aa  199  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  35.19 
 
 		 558 aa  199  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.57 
 
 		 598 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  36.3 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  33.96 
 
 		 592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.64 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  35.41 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  33.73 
 
 		 550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5729  L-aspartate oxidase  37.71 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  36.61 
 
 		 509 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.8 
 
 		 578 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  34.53 
 
 		 525 aa  198  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  35.57 
 
 		 552 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  33.1 
 
 		 602 aa  198  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  33.57 
 
 		 601 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  34.4 
 
 		 532 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  33.57 
 
 		 601 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  34.41 
 
 		 511 aa  196  7e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  33.33 
 
 		 598 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.87 
 
 		 602 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.87 
 
 		 595 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  34.55 
 
 		 531 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  33.73 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  34.79 
 
 		 531 aa  195  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  35.81 
 
 		 847 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  40 
 
 		 556 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  34.52 
 
 		 540 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  34.33 
 
 		 533 aa  195  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  34.68 
 
 		 591 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  34.75 
 
 		 540 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.38 
 
 		 579 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.72 
 
 		 603 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  34.52 
 
 		 540 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  34.52 
 
 		 540 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  34.91 
 
 		 552 aa  194  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.5 
 
 		 637 aa  194  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  34.28 
 
 		 539 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>