More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1387 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
522 aa  1036    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  55.77 
 
 
545 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  53.2 
 
 
532 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  49.52 
 
 
542 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  48.07 
 
 
535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.66 
 
 
536 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  48.06 
 
 
526 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  49.51 
 
 
549 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  49.31 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.28 
 
 
540 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  48.23 
 
 
532 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  49.42 
 
 
540 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  48.23 
 
 
532 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  48.23 
 
 
532 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  46.8 
 
 
563 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  26.53 
 
 
591 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  25.78 
 
 
576 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.94 
 
 
556 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  23.54 
 
 
534 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  25.92 
 
 
582 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  25.92 
 
 
582 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.35 
 
 
610 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  26.79 
 
 
568 aa  90.1  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.43 
 
 
574 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.43 
 
 
574 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  26.19 
 
 
580 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  25.88 
 
 
578 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  29.37 
 
 
548 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  29.37 
 
 
548 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  27.54 
 
 
574 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  28.73 
 
 
535 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  25.6 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  24.95 
 
 
578 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.82 
 
 
587 aa  84  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.25 
 
 
599 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  26.21 
 
 
580 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.27 
 
 
540 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  26.48 
 
 
574 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  29.76 
 
 
533 aa  80.5  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  23.03 
 
 
532 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.02 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  26.34 
 
 
579 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  25.13 
 
 
583 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  24.23 
 
 
535 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.72 
 
 
568 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  27.27 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  27.99 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.27 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.27 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.27 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.27 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  27.55 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  26.06 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  26.09 
 
 
579 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2645  L-aspartate oxidase  29.4 
 
 
509 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.44 
 
 
599 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  25.46 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  27.41 
 
 
863 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  27.82 
 
 
954 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.36 
 
 
543 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  24.57 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  25.91 
 
 
579 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  25.23 
 
 
579 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3618  L-aspartate oxidase  30.87 
 
 
519 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203775  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  27.44 
 
 
507 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  25.68 
 
 
542 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  25.23 
 
 
531 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0634  L-aspartate oxidase  27.66 
 
 
558 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  27 
 
 
538 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.96 
 
 
600 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5622  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.92 
 
 
591 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1661  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.92 
 
 
591 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.729694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2799  L-aspartate oxidase  30.11 
 
 
514 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15291  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  24.33 
 
 
531 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.6 
 
 
596 aa  71.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  28.16 
 
 
575 aa  70.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  26.05 
 
 
577 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  24.09 
 
 
537 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  25.32 
 
 
546 aa  70.5  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.48 
 
 
566 aa  70.5  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  26.33 
 
 
535 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2871  L-aspartate oxidase  30.85 
 
 
509 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  24.09 
 
 
537 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1965  L-aspartate oxidase  22.42 
 
 
623 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.25 
 
 
598 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  24.73 
 
 
536 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0379  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 
641 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  21.43 
 
 
528 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  23.91 
 
 
537 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  26.05 
 
 
576 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  21.96 
 
 
542 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10840  L-aspartate oxidase  28.67 
 
 
557 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24876  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.45 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  23.33 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.86 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1547  L-aspartate oxidase  28.67 
 
 
580 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.09 
 
 
542 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.13 
 
 
605 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  24.54 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  24.54 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>