More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1547 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1547  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 580 aa  1162    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  31.38 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  31.03 
 
 		 515 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.63 
 
 		 601 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.34 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  27.35 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  30.73 
 
 		 576 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.47 
 
 		 562 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.59 
 
 		 540 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  30.44 
 
 		 577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.06 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.75 
 
 		 542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  31.29 
 
 		 863 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.85 
 
 		 589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  29.4 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  27.58 
 
 		 538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.64 
 
 		 638 aa  163  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1684  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.75 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.04 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.86 
 
 		 539 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.77 
 
 		 552 aa  160  7e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.64 
 
 		 539 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.96 
 
 		 546 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  28.95 
 
 		 535 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.29 
 
 		 608 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.62 
 
 		 648 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  27.62 
 
 		 556 aa  158  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.62 
 
 		 648 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  27.42 
 
 		 534 aa  157  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  27.18 
 
 		 565 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  28.07 
 
 		 571 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  29.66 
 
 		 533 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  29.12 
 
 		 535 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  29.66 
 
 		 535 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  29.41 
 
 		 552 aa  156  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  29.66 
 
 		 570 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  28.95 
 
 		 535 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  29.66 
 
 		 533 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  29.66 
 
 		 570 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  28.7 
 
 		 552 aa  156  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  29.66 
 
 		 570 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  29.66 
 
 		 570 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  29.66 
 
 		 570 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  28.08 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.95 
 
 		 646 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1392  L-aspartate oxidase  28.75 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711927  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  28.16 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  28.75 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.29 
 
 		 648 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  30.09 
 
 		 528 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  27.18 
 
 		 568 aa  153  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  29.66 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  32.74 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2315  L-aspartate oxidase  29.31 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  27.7 
 
 		 532 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  30.55 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.33 
 
 		 644 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  30.46 
 
 		 534 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.26 
 
 		 643 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  28.07 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  30.28 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.79 
 
 		 611 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.86 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  29.67 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  27.74 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  29.39 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  27.65 
 
 		 525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  29.33 
 
 		 533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  28.37 
 
 		 532 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  29.02 
 
 		 528 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  29.02 
 
 		 528 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  29.02 
 
 		 528 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  30.69 
 
 		 541 aa  146  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  25.96 
 
 		 528 aa  146  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.88 
 
 		 597 aa  146  1e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  29.2 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  29.2 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.13 
 
 		 612 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  28.75 
 
 		 542 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  29.62 
 
 		 557 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  27.75 
 
 		 560 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  28.67 
 
 		 529 aa  145  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.71 
 
 		 646 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  29.8 
 
 		 532 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  29.35 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  26.49 
 
 		 609 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  26.4 
 
 		 533 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0410  L-aspartate oxidase  28.85 
 
 		 532 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.632554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  27.59 
 
 		 558 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  27.59 
 
 		 557 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  28.32 
 
 		 535 aa  143  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0833  L-aspartate oxidase  26.52 
 
 		 549 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  27.13 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  29.47 
 
 		 567 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  25.64 
 
 		 584 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  26.19 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0862  L-aspartate oxidase  26.34 
 
 		 549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.94 
 
 		 567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  29.62 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.65 
 
 		 621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>