More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2084 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 601 aa  1243    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.42 
 
 		 589 aa  474  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.39 
 
 		 539 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.97 
 
 		 539 aa  236  7e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.62 
 
 		 539 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.82 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  30.82 
 
 		 576 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.56 
 
 		 542 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.02 
 
 		 644 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.2 
 
 		 546 aa  212  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.26 
 
 		 540 aa  210  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.88 
 
 		 562 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.03 
 
 		 543 aa  203  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  29.68 
 
 		 576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.68 
 
 		 542 aa  201  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.67 
 
 		 627 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.18 
 
 		 648 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.18 
 
 		 638 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.18 
 
 		 648 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.18 
 
 		 648 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.59 
 
 		 646 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.37 
 
 		 623 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  28.36 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.82 
 
 		 599 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.16 
 
 		 643 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  28.67 
 
 		 584 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1489  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.21 
 
 		 694 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  26.85 
 
 		 575 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1385  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.89 
 
 		 694 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.9 
 
 		 602 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  26.45 
 
 		 641 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.5 
 
 		 606 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.68 
 
 		 570 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3806  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.87 
 
 		 693 aa  174  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.168635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  27.19 
 
 		 646 aa  173  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.15 
 
 		 637 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04034  hypothetical protein  31.18 
 
 		 682 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04072  putative oxidoreductase  31.18 
 
 		 690 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4767  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.71 
 
 		 693 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.173311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4450  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.18 
 
 		 693 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0592294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.97 
 
 		 637 aa  171  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.54 
 
 		 621 aa  170  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.84 
 
 		 617 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.46 
 
 		 644 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  28.22 
 
 		 598 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4677  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.55 
 
 		 693 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.55 
 
 		 566 aa  166  8e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.7 
 
 		 691 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.429912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  25.92 
 
 		 568 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0493  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.28 
 
 		 664 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0517  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.28 
 
 		 664 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.7 
 
 		 626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.71 
 
 		 646 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26 
 
 		 608 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.41 
 
 		 598 aa  165  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1547  L-aspartate oxidase  28.49 
 
 		 580 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.27 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  25.63 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  27 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  27.15 
 
 		 532 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  26.51 
 
 		 633 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  27.12 
 
 		 542 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  28.98 
 
 		 534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  27.33 
 
 		 515 aa  157  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  27.06 
 
 		 555 aa  156  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  27.29 
 
 		 539 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  27.56 
 
 		 540 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  28.04 
 
 		 535 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  27.99 
 
 		 552 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  27.56 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  27.56 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  27.38 
 
 		 540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  26.9 
 
 		 515 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  28.3 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  26.33 
 
 		 540 aa  154  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  26.76 
 
 		 540 aa  154  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  28.45 
 
 		 538 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  28.12 
 
 		 538 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  26.33 
 
 		 540 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  26.33 
 
 		 540 aa  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  26.33 
 
 		 540 aa  153  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  26.33 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  26.33 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.96 
 
 		 681 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  28.62 
 
 		 546 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  28.79 
 
 		 541 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0037  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.33 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.994153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25.84 
 
 		 601 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  27.4 
 
 		 539 aa  151  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  28.3 
 
 		 529 aa  150  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  27.15 
 
 		 533 aa  150  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.77 
 
 		 601 aa  150  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  23.77 
 
 		 601 aa  150  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  26.38 
 
 		 534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  27.38 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  26.16 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  27.26 
 
 		 541 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  26.62 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  27.57 
 
 		 534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  26.62 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>