More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1489 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04072  putative oxidoreductase  55.09 
 
 
690 aa  748    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04034  hypothetical protein  54.95 
 
 
682 aa  732    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3806  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  55.23 
 
 
693 aa  746    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.168635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1385  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  89.91 
 
 
694 aa  1285    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919125  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.89 
 
 
691 aa  730    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.429912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4450  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.09 
 
 
693 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0592294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4767  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.09 
 
 
693 aa  744    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.173311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4677  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.8 
 
 
693 aa  745    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1489  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
694 aa  1417    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0493  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.66 
 
 
664 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0517  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.66 
 
 
664 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06460  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  38.75 
 
 
753 aa  350  5e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.91 
 
 
679 aa  346  7e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0530357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.21 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.56 
 
 
589 aa  147  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.63 
 
 
543 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.63 
 
 
542 aa  92  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.47 
 
 
540 aa  86.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.93 
 
 
638 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  24.88 
 
 
576 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.33 
 
 
566 aa  84.3  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  21.46 
 
 
532 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.95 
 
 
626 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.84 
 
 
542 aa  82  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.12 
 
 
601 aa  80.1  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  21.54 
 
 
594 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  23.29 
 
 
602 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  26.11 
 
 
598 aa  77.8  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.43 
 
 
601 aa  77  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  23.43 
 
 
601 aa  77  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0437  L-aspartate oxidase  27.14 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1003  L-aspartate oxidase  27.81 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  23.36 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.69 
 
 
592 aa  74.3  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.99 
 
 
643 aa  73.9  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.06 
 
 
602 aa  73.9  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.48 
 
 
562 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.85 
 
 
591 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.26 
 
 
646 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.3 
 
 
598 aa  72.8  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.38 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.85 
 
 
591 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.42 
 
 
582 aa  73.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.37 
 
 
637 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.48 
 
 
601 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  21.53 
 
 
597 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  26.24 
 
 
577 aa  70.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.24 
 
 
591 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.12 
 
 
575 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.24 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.43 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.12 
 
 
575 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.24 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.24 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  21.53 
 
 
602 aa  70.1  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.43 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.69 
 
 
539 aa  70.5  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.43 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.24 
 
 
644 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.24 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.24 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.24 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.24 
 
 
591 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.49 
 
 
591 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.68 
 
 
579 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.49 
 
 
591 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  23.14 
 
 
573 aa  68.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  24.45 
 
 
641 aa  68.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  22.52 
 
 
522 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  23.85 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.5 
 
 
592 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3128  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.46 
 
 
610 aa  68.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.69 
 
 
539 aa  67.8  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.26 
 
 
592 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.02 
 
 
581 aa  67.8  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.16 
 
 
608 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.5 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  23.69 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.14 
 
 
592 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.14 
 
 
592 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.14 
 
 
592 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.4 
 
 
552 aa  67  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6034  L-aspartate oxidase  26.38 
 
 
519 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.536224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  22.94 
 
 
528 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  23.94 
 
 
598 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0936  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.12 
 
 
612 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  22.97 
 
 
565 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.55 
 
 
546 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  24.73 
 
 
566 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.56 
 
 
583 aa  65.1  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.33 
 
 
590 aa  65.1  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3978  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.34 
 
 
613 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  23.55 
 
 
596 aa  65.1  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3690  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.16 
 
 
613 aa  64.7  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.66 
 
 
577 aa  64.3  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  27.27 
 
 
598 aa  64.3  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2104  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.51 
 
 
574 aa  64.3  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0119641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4756  L-aspartate oxidase  24.86 
 
 
517 aa  63.9  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127906  normal  0.41512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.09 
 
 
592 aa  63.9  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.82 
 
 
604 aa  63.9  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>