246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4741 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04072  putative oxidoreductase  94.88 
 
 		 690 aa  1355    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4450  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  90.34 
 
 		 693 aa  1276    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0592294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04034  hypothetical protein  94.28 
 
 		 682 aa  1340    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3806  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  90.34 
 
 		 693 aa  1278    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.168635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1489  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.89 
 
 		 694 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4677  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  88.14 
 
 		 693 aa  1248    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4767  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  90.34 
 
 		 693 aa  1277    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.173311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 691 aa  1436    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.429912  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1385  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.97 
 
 		 694 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0517  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.1 
 
 		 664 aa  350  5e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0493  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34.96 
 
 		 664 aa  348  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06460  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  35.58 
 
 		 753 aa  295  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.21 
 
 		 679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0530357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.7 
 
 		 601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.59 
 
 		 589 aa  138  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  24.39 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.52 
 
 		 539 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.05 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.38 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.8 
 
 		 539 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  28.53 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0377  L-aspartate oxidase  22.44 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.48 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.54 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0383  L-aspartate oxidase  22.62 
 
 		 439 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.1 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.82 
 
 		 646 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  25.2 
 
 		 867 aa  67.4  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  24.23 
 
 		 566 aa  67  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.61 
 
 		 562 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  23.25 
 
 		 571 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  22.09 
 
 		 532 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  25.84 
 
 		 557 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  24.07 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.28 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2335  L-aspartate oxidase  25.11 
 
 		 552 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  29.75 
 
 		 863 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.23 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.41 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  24.18 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  24.18 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  26.39 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.04 
 
 		 648 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  22.74 
 
 		 568 aa  60.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  28.33 
 
 		 633 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  22.24 
 
 		 536 aa  60.1  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  30.43 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  41.46 
 
 		 872 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  23.01 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.21 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.21 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  23.06 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01131  L-aspartate oxidase  25.11 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  21.66 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  24.13 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  25.21 
 
 		 537 aa  58.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2775  L-aspartate oxidase  26.22 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.36 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  22.95 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.12 
 
 		 638 aa  57.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  30.23 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  21.9 
 
 		 536 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  34.12 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  22.75 
 
 		 509 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.94 
 
 		 644 aa  57  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.98 
 
 		 579 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1003  L-aspartate oxidase  30.5 
 
 		 534 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.28 
 
 		 552 aa  56.6  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.14 
 
 		 623 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  23.5 
 
 		 483 aa  55.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  35.9 
 
 		 847 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  25.98 
 
 		 641 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  29.03 
 
 		 535 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  29.03 
 
 		 535 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  25.28 
 
 		 548 aa  54.7  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  24.19 
 
 		 509 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  29.03 
 
 		 535 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.07 
 
 		 680 aa  54.3  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2374  L-aspartate oxidase  34.44 
 
 		 558 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  22.98 
 
 		 537 aa  54.3  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  23.13 
 
 		 556 aa  53.9  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  25.41 
 
 		 500 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  23.52 
 
 		 609 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  23.26 
 
 		 565 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1746  L-aspartate oxidase  30.04 
 
 		 553 aa  53.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359487 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  24.52 
 
 		 512 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1547  L-aspartate oxidase  24.36 
 
 		 580 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  23.01 
 
 		 509 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  23.87 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  24.04 
 
 		 509 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  23.87 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  24.06 
 
 		 598 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.65 
 
 		 626 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.49 
 
 		 627 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  25.44 
 
 		 535 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  21.34 
 
 		 537 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.96 
 
 		 681 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1684  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.89 
 
 		 541 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.61 
 
 		 542 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0637  L-aspartate oxidase  30.65 
 
 		 572 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.420562  normal  0.605731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>