More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3806 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04072  putative oxidoreductase  94.33 
 
 		 690 aa  1336    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4677  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  97.4 
 
 		 693 aa  1402    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4450  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  99.42 
 
 		 693 aa  1430    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0592294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1385  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.44 
 
 		 694 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  90.34 
 
 		 691 aa  1278    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.429912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1489  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.23 
 
 		 694 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04034  hypothetical protein  93.99 
 
 		 682 aa  1316    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4767  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  99.57 
 
 		 693 aa  1431    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.173311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3806  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 		 693 aa  1437    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.168635 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0517  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.7 
 
 		 664 aa  360  7e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0493  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.4 
 
 		 664 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06460  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  36.01 
 
 		 753 aa  300  6e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.19 
 
 		 679 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0530357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.87 
 
 		 601 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.15 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  25.31 
 
 		 545 aa  90.9  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.33 
 
 		 542 aa  84.7  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.17 
 
 		 539 aa  84  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.26 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.36 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.47 
 
 		 542 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0377  L-aspartate oxidase  22.89 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  27.6 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.21 
 
 		 562 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  25.14 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.28 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0383  L-aspartate oxidase  23.06 
 
 		 439 aa  77  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.17 
 
 		 540 aa  73.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.78 
 
 		 646 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  22.95 
 
 		 532 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  23.63 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  25.39 
 
 		 867 aa  71.6  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  22.53 
 
 		 536 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  26.26 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  22.69 
 
 		 536 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2335  L-aspartate oxidase  25.55 
 
 		 552 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.28 
 
 		 546 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  22.38 
 
 		 536 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  26.25 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.29 
 
 		 648 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  25.71 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.74 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  22.6 
 
 		 538 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  24.62 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  24.62 
 
 		 558 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.96 
 
 		 646 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  22.76 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  22.15 
 
 		 537 aa  65.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  23.06 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01131  L-aspartate oxidase  25.56 
 
 		 562 aa  65.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  31.01 
 
 		 863 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.7 
 
 		 598 aa  65.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  22.59 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  22.03 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  22.59 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  22.59 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.1 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  24.57 
 
 		 528 aa  64.7  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.1 
 
 		 648 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  22.72 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.78 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  24.59 
 
 		 609 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  23.16 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1547  L-aspartate oxidase  24.66 
 
 		 580 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  22.41 
 
 		 568 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.51 
 
 		 638 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  21.69 
 
 		 534 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  21.34 
 
 		 534 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  22.55 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  21.69 
 
 		 535 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  21.88 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  22.55 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  23.95 
 
 		 483 aa  62  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  33.1 
 
 		 872 aa  62  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  30.77 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  21.93 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  24.45 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.19 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.94 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  33.65 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  21.69 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.2 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2775  L-aspartate oxidase  26.67 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  24.95 
 
 		 512 aa  60.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.68 
 
 		 544 aa  60.1  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1003  L-aspartate oxidase  31.37 
 
 		 534 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.42 
 
 		 608 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  23.85 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  27.95 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.24 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2374  L-aspartate oxidase  33.33 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.919868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  26.83 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0213  L-aspartate oxidase  24.02 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  25.87 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  37.18 
 
 		 847 aa  58.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  26.42 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  23.35 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  23.35 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  25 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  30.87 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>