More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0445 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
589 aa  1201    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.93 
 
 
601 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.55 
 
 
540 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  28.6 
 
 
576 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.12 
 
 
539 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.76 
 
 
539 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.94 
 
 
539 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.11 
 
 
542 aa  195  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.72 
 
 
543 aa  194  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.15 
 
 
546 aa  191  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  28.12 
 
 
576 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.47 
 
 
562 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.91 
 
 
599 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  28.05 
 
 
575 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.94 
 
 
617 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.46 
 
 
566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.51 
 
 
542 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.32 
 
 
648 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.32 
 
 
648 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.07 
 
 
575 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.41 
 
 
552 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.08 
 
 
606 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.32 
 
 
648 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.13 
 
 
602 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  28.55 
 
 
529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  28.98 
 
 
584 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.23 
 
 
566 aa  177  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.72 
 
 
627 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  27.73 
 
 
535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.76 
 
 
638 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  26.34 
 
 
596 aa  173  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.94 
 
 
644 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.65 
 
 
575 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.65 
 
 
575 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  28.32 
 
 
582 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.6 
 
 
570 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  27.01 
 
 
557 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  27.01 
 
 
558 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.9 
 
 
578 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.53 
 
 
643 aa  166  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.05 
 
 
646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  27.98 
 
 
570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.1 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  28.09 
 
 
542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  27.14 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.44 
 
 
637 aa  165  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.07 
 
 
637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  28.52 
 
 
641 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.36 
 
 
603 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  26.88 
 
 
515 aa  163  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0037  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  32.02 
 
 
533 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.994153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.16 
 
 
575 aa  161  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.55 
 
 
598 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.46 
 
 
623 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  28.18 
 
 
546 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  27.98 
 
 
545 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  26.96 
 
 
528 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1489  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.61 
 
 
694 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.27 
 
 
589 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.23 
 
 
598 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  26.77 
 
 
646 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.69 
 
 
542 aa  157  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1547  L-aspartate oxidase  27.48 
 
 
580 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  27.66 
 
 
522 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  26.6 
 
 
533 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1385  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.71 
 
 
694 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919125  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  25.08 
 
 
577 aa  154  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  26.21 
 
 
598 aa  154  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04034  hypothetical protein  27.72 
 
 
682 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  27.35 
 
 
573 aa  154  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04072  putative oxidoreductase  27.72 
 
 
690 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3806  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.72 
 
 
693 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.168635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.72 
 
 
598 aa  153  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  26.74 
 
 
552 aa  153  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  27.3 
 
 
633 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.58 
 
 
579 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  26.78 
 
 
568 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  26.33 
 
 
532 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4450  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.54 
 
 
693 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0592294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.66 
 
 
595 aa  152  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4767  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.54 
 
 
693 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.173311  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  26.74 
 
 
552 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1776  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.07 
 
 
584 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.69 
 
 
584 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  27.04 
 
 
538 aa  151  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1587  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.69 
 
 
584 aa  151  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243588  normal  0.596865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.3 
 
 
607 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  26.56 
 
 
507 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.3 
 
 
607 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.3 
 
 
607 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.16 
 
 
591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.07 
 
 
583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1388  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.58 
 
 
580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.394605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.13 
 
 
598 aa  148  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  24.54 
 
 
609 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  26.71 
 
 
541 aa  148  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.35 
 
 
583 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.49 
 
 
593 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  26.54 
 
 
534 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  25.39 
 
 
538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>