More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0471 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  86.6 
 
 
602 aa  1033    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  86.6 
 
 
602 aa  1033    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.05 
 
 
606 aa  930    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.77 
 
 
602 aa  1035    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4613  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.45 
 
 
596 aa  1047    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.79 
 
 
607 aa  1087    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.6 
 
 
602 aa  1033    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.62 
 
 
596 aa  1060    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.79 
 
 
607 aa  1087    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.79 
 
 
607 aa  1087    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  91.14 
 
 
598 aa  1115    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.6 
 
 
602 aa  1033    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.91 
 
 
599 aa  944    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  75.09 
 
 
617 aa  939    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.62 
 
 
596 aa  1060    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4761  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.62 
 
 
596 aa  1048    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.838458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1725  fumarate reductase flavoprotein subunit  64.74 
 
 
594 aa  752    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  91.47 
 
 
598 aa  1136    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.25 
 
 
602 aa  1031    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1277  fumarate reductase flavoprotein subunit  79.07 
 
 
599 aa  947    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.572421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.6 
 
 
602 aa  1033    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.29 
 
 
596 aa  1053    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  75.9 
 
 
602 aa  942    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.43 
 
 
602 aa  1031    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.24 
 
 
591 aa  895    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
598 aa  1249    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  86.6 
 
 
602 aa  1033    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  67.12 
 
 
603 aa  839    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4740  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.45 
 
 
596 aa  1046    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  95.32 
 
 
598 aa  1174    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  91.81 
 
 
598 aa  1136    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1450  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.25 
 
 
590 aa  633  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.06 
 
 
583 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0166  Succinate dehydrogenase  48.84 
 
 
711 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  46.86 
 
 
568 aa  479  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.55 
 
 
598 aa  473  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.72 
 
 
581 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  42.61 
 
 
596 aa  455  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.95 
 
 
575 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.44 
 
 
575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.3 
 
 
582 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.93 
 
 
579 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  45.13 
 
 
567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.44 
 
 
575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  43.79 
 
 
567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.76 
 
 
567 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.62 
 
 
567 aa  452  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.24 
 
 
581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.33 
 
 
567 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.78 
 
 
567 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.94 
 
 
575 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.09 
 
 
578 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.22 
 
 
584 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.41 
 
 
598 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  40.92 
 
 
573 aa  439  9.999999999999999e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  42.29 
 
 
570 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.52 
 
 
604 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.55 
 
 
612 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  44.67 
 
 
567 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.63 
 
 
592 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.03 
 
 
595 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  41.19 
 
 
570 aa  431  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.23 
 
 
612 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.17 
 
 
605 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.01 
 
 
605 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.17 
 
 
605 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.29 
 
 
592 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.22 
 
 
598 aa  428  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  41.48 
 
 
567 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.36 
 
 
611 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  41.23 
 
 
572 aa  426  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.3 
 
 
604 aa  428  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  40.99 
 
 
592 aa  429  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.13 
 
 
577 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.29 
 
 
592 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.29 
 
 
592 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.63 
 
 
592 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.13 
 
 
592 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.21 
 
 
566 aa  424  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.75 
 
 
592 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.46 
 
 
595 aa  425  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.89 
 
 
575 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.09 
 
 
595 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.13 
 
 
595 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.67 
 
 
593 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  41.12 
 
 
592 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.12 
 
 
605 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.3 
 
 
566 aa  421  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41 
 
 
591 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41 
 
 
591 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.28 
 
 
607 aa  422  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41 
 
 
591 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.33 
 
 
611 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.53 
 
 
594 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41 
 
 
591 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.41 
 
 
596 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.62 
 
 
596 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  41.34 
 
 
587 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.3 
 
 
602 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41 
 
 
591 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>