More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4613 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.45 
 
 
598 aa  1067    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  94.68 
 
 
602 aa  1135    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.68 
 
 
602 aa  1135    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  94.68 
 
 
602 aa  1135    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.37 
 
 
599 aa  927    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.52 
 
 
602 aa  1133    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.68 
 
 
602 aa  1135    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.79 
 
 
598 aa  1060    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.67 
 
 
607 aa  1061    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.3 
 
 
596 aa  1139    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  94.68 
 
 
602 aa  1135    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.79 
 
 
598 aa  1074    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.18 
 
 
602 aa  928    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4613  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
596 aa  1244    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.8 
 
 
598 aa  1087    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  99.66 
 
 
596 aa  1242    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.12 
 
 
598 aa  1066    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4740  fumarate reductase flavoprotein subunit  99.66 
 
 
596 aa  1241    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1725  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.38 
 
 
594 aa  736    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.52 
 
 
602 aa  1133    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.37 
 
 
617 aa  922    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1277  fumarate reductase flavoprotein subunit  78.04 
 
 
599 aa  941    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.572421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.52 
 
 
602 aa  1133    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  71.04 
 
 
591 aa  862    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  99.66 
 
 
596 aa  1242    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.67 
 
 
607 aa  1061    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4761  fumarate reductase flavoprotein subunit  99.83 
 
 
596 aa  1243    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.838458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.68 
 
 
606 aa  915    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  67.12 
 
 
603 aa  834    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.68 
 
 
602 aa  1137    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.67 
 
 
607 aa  1061    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1450  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.26 
 
 
590 aa  619  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.02 
 
 
583 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0166  Succinate dehydrogenase  46.6 
 
 
711 aa  511  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  45.12 
 
 
568 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.67 
 
 
598 aa  450  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  44.5 
 
 
567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.81 
 
 
581 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  42.83 
 
 
567 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.89 
 
 
575 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.98 
 
 
581 aa  440  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.74 
 
 
582 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.51 
 
 
575 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.7 
 
 
567 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.02 
 
 
579 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.07 
 
 
567 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.21 
 
 
612 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  42.49 
 
 
567 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  40.64 
 
 
596 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.26 
 
 
592 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.73 
 
 
567 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.94 
 
 
604 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.98 
 
 
598 aa  434  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.88 
 
 
612 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.97 
 
 
567 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.64 
 
 
596 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.57 
 
 
575 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.49 
 
 
595 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.62 
 
 
567 aa  428  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.28 
 
 
577 aa  428  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.5 
 
 
578 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  40.33 
 
 
592 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.57 
 
 
575 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.58 
 
 
596 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.38 
 
 
611 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.9 
 
 
604 aa  425  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.06 
 
 
595 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.3 
 
 
596 aa  424  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  40.29 
 
 
570 aa  421  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.86 
 
 
594 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.43 
 
 
592 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  41.11 
 
 
598 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.67 
 
 
592 aa  422  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.98 
 
 
595 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.89 
 
 
596 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  40.72 
 
 
572 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.09 
 
 
595 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.43 
 
 
592 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.43 
 
 
592 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.43 
 
 
592 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.58 
 
 
605 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.3 
 
 
602 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.17 
 
 
591 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.13 
 
 
590 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.51 
 
 
592 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.1 
 
 
607 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.17 
 
 
591 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.9 
 
 
591 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.17 
 
 
591 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.73 
 
 
591 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.9 
 
 
591 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.56 
 
 
596 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.17 
 
 
591 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.56 
 
 
605 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.73 
 
 
591 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.9 
 
 
591 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.9 
 
 
591 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.17 
 
 
591 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.17 
 
 
591 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.85 
 
 
566 aa  418  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>