More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04026 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.31 
 
 		 607 aa  1054    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  100 
 
 		 602 aa  1254    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  100 
 
 		 602 aa  1254    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4613  fumarate reductase flavoprotein subunit  95.46 
 
 		 596 aa  1135    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  71.4 
 
 		 591 aa  860    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.05 
 
 		 598 aa  1058    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  95.29 
 
 		 596 aa  1152    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  84.72 
 
 		 598 aa  1053    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  99.83 
 
 		 602 aa  1252    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 602 aa  1254    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  99 
 
 		 602 aa  1245    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.31 
 
 		 607 aa  1054    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.35 
 
 		 602 aa  924    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  95.29 
 
 		 596 aa  1152    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4761  fumarate reductase flavoprotein subunit  95.29 
 
 		 596 aa  1135    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.838458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.05 
 
 		 598 aa  1068    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  99.83 
 
 		 602 aa  1252    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 602 aa  1254    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1277  fumarate reductase flavoprotein subunit  77.53 
 
 		 599 aa  931    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.572421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  99.83 
 
 		 602 aa  1250    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.54 
 
 		 617 aa  918    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.55 
 
 		 598 aa  1060    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1254    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4740  fumarate reductase flavoprotein subunit  95.13 
 
 		 596 aa  1132    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  92.94 
 
 		 596 aa  1120    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.31 
 
 		 607 aa  1054    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.21 
 
 		 598 aa  1072    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.37 
 
 		 606 aa  916    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  66.27 
 
 		 603 aa  828    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.54 
 
 		 599 aa  923    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1725  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.98 
 
 		 594 aa  738    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1450  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.63 
 
 		 590 aa  628  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.7 
 
 		 583 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0166  Succinate dehydrogenase  47.01 
 
 		 711 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.04 
 
 		 598 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  45.28 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.03 
 
 		 579 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  44.72 
 
 		 567 aa  444  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.05 
 
 		 581 aa  445  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  42.93 
 
 		 567 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.22 
 
 		 582 aa  436  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.38 
 
 		 612 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.53 
 
 		 575 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.12 
 
 		 612 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.07 
 
 		 581 aa  438  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  42.83 
 
 		 567 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.19 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.38 
 
 		 595 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.76 
 
 		 592 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.01 
 
 		 604 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.31 
 
 		 598 aa  435  1e-120  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  41.01 
 
 		 596 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.95 
 
 		 611 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  41.03 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.52 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.15 
 
 		 567 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.79 
 
 		 577 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.3 
 
 		 604 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  41.74 
 
 		 572 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.45 
 
 		 605 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.86 
 
 		 567 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40 
 
 		 575 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40 
 
 		 575 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.33 
 
 		 592 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.45 
 
 		 605 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  40.53 
 
 		 592 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.26 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.96 
 
 		 605 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40 
 
 		 578 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.26 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.83 
 
 		 591 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  41.58 
 
 		 598 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.81 
 
 		 595 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.8 
 
 		 567 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.96 
 
 		 605 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.13 
 
 		 596 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.06 
 
 		 595 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.56 
 
 		 596 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.26 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.26 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.62 
 
 		 602 aa  422  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.83 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.23 
 
 		 591 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.1 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.83 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.83 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  40.33 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.2 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.23 
 
 		 591 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.75 
 
 		 596 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.83 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.83 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.23 
 
 		 591 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.23 
 
 		 611 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  39.87 
 
 		 596 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.4 
 
 		 596 aa  422  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.62 
 
 		 567 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.83 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.83 
 
 		 591 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.07 
 
 		 591 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>