More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3758 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 598 aa  1247    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  86.08 
 
 		 602 aa  1031    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  86.08 
 
 		 602 aa  1031    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.95 
 
 		 596 aa  1054    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.28 
 
 		 607 aa  1089    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.62 
 
 		 596 aa  1049    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76.29 
 
 		 599 aa  957    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1450  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.93 
 
 		 590 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.25 
 
 		 602 aa  1033    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.08 
 
 		 602 aa  1031    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4740  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.79 
 
 		 596 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.28 
 
 		 607 aa  1089    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.91 
 
 		 602 aa  1030    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  98.33 
 
 		 598 aa  1233    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  93.48 
 
 		 598 aa  1153    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  91.3 
 
 		 598 aa  1119    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  76.42 
 
 		 602 aa  946    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.28 
 
 		 607 aa  1089    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.95 
 
 		 596 aa  1054    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  86.08 
 
 		 602 aa  1031    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  75.43 
 
 		 617 aa  941    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1725  fumarate reductase flavoprotein subunit  65.08 
 
 		 594 aa  758    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1277  fumarate reductase flavoprotein subunit  78.9 
 
 		 599 aa  946    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.572421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.08 
 
 		 602 aa  1031    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.67 
 
 		 591 aa  879    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.08 
 
 		 602 aa  1030    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.25 
 
 		 602 aa  1032    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4761  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.95 
 
 		 596 aa  1043    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.838458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  75.6 
 
 		 606 aa  942    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  66.72 
 
 		 603 aa  836    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  91.81 
 
 		 598 aa  1136    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4613  fumarate reductase flavoprotein subunit  85.79 
 
 		 596 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.42 
 
 		 583 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0166  Succinate dehydrogenase  48.26 
 
 		 711 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.48 
 
 		 598 aa  474  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  45.96 
 
 		 568 aa  474  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.95 
 
 		 575 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.69 
 
 		 579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.11 
 
 		 575 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.47 
 
 		 598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  45.03 
 
 		 567 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.69 
 
 		 595 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.74 
 
 		 575 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.74 
 
 		 575 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.45 
 
 		 567 aa  451  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  41.6 
 
 		 596 aa  452  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.89 
 
 		 581 aa  449  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.09 
 
 		 592 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.53 
 
 		 578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.23 
 
 		 567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.05 
 
 		 582 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.31 
 
 		 567 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.2 
 
 		 584 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.01 
 
 		 604 aa  445  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  43.38 
 
 		 567 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42 
 
 		 567 aa  442  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.62 
 
 		 612 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.15 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.25 
 
 		 598 aa  437  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  41.16 
 
 		 592 aa  438  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.15 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.15 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.5 
 
 		 592 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.95 
 
 		 581 aa  436  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43 
 
 		 577 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  44.3 
 
 		 567 aa  434  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  41.84 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.13 
 
 		 604 aa  435  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  41.45 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.76 
 
 		 612 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  40.41 
 
 		 573 aa  432  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.98 
 
 		 592 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.05 
 
 		 596 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.62 
 
 		 605 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.93 
 
 		 592 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.29 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  41.65 
 
 		 598 aa  432  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.65 
 
 		 595 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43 
 
 		 595 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.83 
 
 		 595 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.95 
 
 		 602 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.55 
 
 		 611 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.22 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  40.65 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.79 
 
 		 607 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.29 
 
 		 605 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.41 
 
 		 605 aa  429  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.54 
 
 		 575 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.69 
 
 		 596 aa  425  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.31 
 
 		 596 aa  427  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.09 
 
 		 596 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.67 
 
 		 605 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.89 
 
 		 591 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.21 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.89 
 
 		 591 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.9 
 
 		 591 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.72 
 
 		 596 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.23 
 
 		 591 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.57 
 
 		 591 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  39.77 
 
 		 596 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>