More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1725 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  63.99 
 
 		 602 aa  736    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  63.99 
 
 		 602 aa  736    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.18 
 
 		 596 aa  734    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  64.91 
 
 		 598 aa  766    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4613  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.88 
 
 		 596 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.26 
 
 		 607 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  65.42 
 
 		 598 aa  770    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  64.91 
 
 		 598 aa  767    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4761  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.88 
 
 		 596 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.838458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.26 
 
 		 599 aa  763    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.65 
 
 		 602 aa  733    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  64.74 
 
 		 598 aa  764    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  64.16 
 
 		 602 aa  739    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.71 
 
 		 596 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4740  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.88 
 
 		 596 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.26 
 
 		 607 aa  744    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.99 
 
 		 602 aa  736    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  64.41 
 
 		 598 aa  756    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1277  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.46 
 
 		 599 aa  728    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.572421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.49 
 
 		 617 aa  771    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.99 
 
 		 602 aa  736    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.26 
 
 		 607 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1725  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 594 aa  1222    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1450  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.13 
 
 		 590 aa  654    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.54 
 
 		 602 aa  761    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.99 
 
 		 602 aa  736    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.46 
 
 		 591 aa  725    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.61 
 
 		 606 aa  765    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.16 
 
 		 603 aa  775    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.99 
 
 		 602 aa  736    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  63.99 
 
 		 602 aa  736    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.71 
 
 		 596 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.08 
 
 		 583 aa  596  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0166  Succinate dehydrogenase  45.4 
 
 		 711 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.93 
 
 		 598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.83 
 
 		 581 aa  431  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.5 
 
 		 582 aa  431  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.83 
 
 		 581 aa  431  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  40.28 
 
 		 573 aa  424  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.88 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.75 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  41.46 
 
 		 596 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.47 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.44 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.64 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.44 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.55 
 
 		 578 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  41.97 
 
 		 567 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.18 
 
 		 567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.83 
 
 		 592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.49 
 
 		 567 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.23 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.2 
 
 		 583 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.4 
 
 		 605 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.36 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.53 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.48 
 
 		 605 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.7 
 
 		 592 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.06 
 
 		 567 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  40.32 
 
 		 568 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.44 
 
 		 595 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.09 
 
 		 591 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.71 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1388  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.61 
 
 		 580 aa  398  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.394605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.07 
 
 		 584 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.93 
 
 		 591 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  39.41 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.93 
 
 		 591 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.74 
 
 		 601 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.93 
 
 		 591 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.08 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.09 
 
 		 591 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.23 
 
 		 592 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.42 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.87 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.72 
 
 		 592 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.03 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.42 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.42 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.76 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.42 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.42 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.69 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.09 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.42 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.63 
 
 		 584 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1015  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.45 
 
 		 610 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.13 
 
 		 600 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39 
 
 		 593 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.11 
 
 		 605 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.76 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.76 
 
 		 599 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.67 
 
 		 595 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.72 
 
 		 592 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.55 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.72 
 
 		 592 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.42 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.63 
 
 		 579 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.42 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>