More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3667 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.33 
 
 		 591 aa  874    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  87.14 
 
 		 602 aa  1035    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  87.14 
 
 		 602 aa  1035    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.79 
 
 		 598 aa  1088    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.61 
 
 		 598 aa  1093    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4761  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.84 
 
 		 596 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.838458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4613  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.67 
 
 		 596 aa  1040    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.84 
 
 		 596 aa  1055    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 607 aa  1266    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  75.56 
 
 		 602 aa  937    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  87.14 
 
 		 602 aa  1035    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.74 
 
 		 599 aa  936    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4740  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.67 
 
 		 596 aa  1040    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1725  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.26 
 
 		 594 aa  735    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.84 
 
 		 596 aa  1055    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.96 
 
 		 602 aa  1034    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 607 aa  1266    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1277  fumarate reductase flavoprotein subunit  78.9 
 
 		 599 aa  933    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.572421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.14 
 
 		 602 aa  1035    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.23 
 
 		 596 aa  1053    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.28 
 
 		 598 aa  1089    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.23 
 
 		 606 aa  926    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.12 
 
 		 598 aa  1089    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.96 
 
 		 602 aa  1033    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.14 
 
 		 602 aa  1035    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 607 aa  1266    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.88 
 
 		 617 aa  920    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  93.73 
 
 		 598 aa  1150    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  67.35 
 
 		 603 aa  834    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.96 
 
 		 602 aa  1033    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  87.14 
 
 		 602 aa  1034    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1450  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.94 
 
 		 590 aa  625  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.51 
 
 		 583 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0166  Succinate dehydrogenase  47.95 
 
 		 711 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.81 
 
 		 598 aa  468  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  46.32 
 
 		 568 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.78 
 
 		 575 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  45.21 
 
 		 567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.3 
 
 		 582 aa  443  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  41.57 
 
 		 596 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.4 
 
 		 575 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.48 
 
 		 581 aa  445  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.4 
 
 		 575 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  44.85 
 
 		 567 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.74 
 
 		 575 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.23 
 
 		 567 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.45 
 
 		 567 aa  438  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.07 
 
 		 598 aa  438  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.86 
 
 		 579 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.24 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.92 
 
 		 578 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.21 
 
 		 612 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.03 
 
 		 595 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.63 
 
 		 567 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.85 
 
 		 604 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.28 
 
 		 581 aa  432  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.83 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  41.2 
 
 		 573 aa  427  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.76 
 
 		 612 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  44.67 
 
 		 567 aa  427  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.34 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.11 
 
 		 592 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.23 
 
 		 604 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  44.04 
 
 		 605 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.61 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  41.1 
 
 		 570 aa  422  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.78 
 
 		 598 aa  423  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.88 
 
 		 611 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.61 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.61 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.44 
 
 		 592 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.88 
 
 		 605 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  41.83 
 
 		 592 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  41.95 
 
 		 567 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.98 
 
 		 605 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.98 
 
 		 605 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.42 
 
 		 595 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.93 
 
 		 611 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.12 
 
 		 596 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.74 
 
 		 592 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.82 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  41.4 
 
 		 572 aa  414  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.74 
 
 		 607 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  39.78 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.86 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.79 
 
 		 596 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.14 
 
 		 595 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.79 
 
 		 577 aa  415  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  42.78 
 
 		 568 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  41.07 
 
 		 592 aa  415  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.5 
 
 		 595 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.67 
 
 		 591 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.11 
 
 		 591 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.39 
 
 		 596 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0070  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.92 
 
 		 607 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  40.89 
 
 		 598 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.5 
 
 		 591 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.11 
 
 		 591 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.59 
 
 		 607 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.1 
 
 		 616 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>