More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4767 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04072  putative oxidoreductase  94.19 
 
 		 690 aa  1334    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04034  hypothetical protein  93.84 
 
 		 682 aa  1315    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4450  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  99.86 
 
 		 693 aa  1436    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0592294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3806  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  99.57 
 
 		 693 aa  1431    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.168635 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  90.34 
 
 		 691 aa  1277    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.429912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4677  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  97.26 
 
 		 693 aa  1400    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4767  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 693 aa  1438    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.173311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1385  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.29 
 
 		 694 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1489  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.09 
 
 		 694 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0517  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.56 
 
 		 664 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0493  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.16 
 
 		 664 aa  357  5e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06460  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  35.95 
 
 		 753 aa  301  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.19 
 
 		 679 aa  293  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0530357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.71 
 
 		 601 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.94 
 
 		 589 aa  142  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  25.48 
 
 		 545 aa  92.8  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.33 
 
 		 542 aa  85.9  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.26 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.47 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.02 
 
 		 539 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  27.46 
 
 		 598 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.14 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0377  L-aspartate oxidase  22.89 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.54 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4377  L-aspartate oxidase  25.14 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.3 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0383  L-aspartate oxidase  23.06 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.17 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.22 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.78 
 
 		 646 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  23.63 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  25.39 
 
 		 867 aa  71.6  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  22.77 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  26.26 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2335  L-aspartate oxidase  25.55 
 
 		 552 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  26.15 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  22.36 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0733  L-aspartate oxidase  25.71 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  22.2 
 
 		 536 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  22.51 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  25.74 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  24.62 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  24.62 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  31.01 
 
 		 863 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  22.15 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.1 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01131  L-aspartate oxidase  25.56 
 
 		 562 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  24.57 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.73 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.02 
 
 		 648 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.02 
 
 		 648 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1974  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  22.59 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  22.24 
 
 		 538 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  23.16 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1547  L-aspartate oxidase  24.43 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.19 
 
 		 598 aa  63.9  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  25.65 
 
 		 556 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  22.41 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  22.41 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  22.72 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.17 
 
 		 638 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  21.86 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  22.41 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  24.41 
 
 		 609 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  33.1 
 
 		 872 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  22.55 
 
 		 537 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  22.24 
 
 		 568 aa  62  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  23.95 
 
 		 483 aa  62  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.2 
 
 		 579 aa  61.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.94 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2775  L-aspartate oxidase  26.67 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0921  L-aspartate oxidase  24.85 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  31.54 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  29.41 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  29.57 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  22.38 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  21.7 
 
 		 537 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.68 
 
 		 544 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  22.38 
 
 		 537 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  21.17 
 
 		 534 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  29.71 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2216  L-aspartate oxidase  24.26 
 
 		 516 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677644  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  21.51 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  23.7 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4590  L-aspartate oxidase  25.87 
 
 		 500 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.125336  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  21.76 
 
 		 538 aa  59.7  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  21.51 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  21.51 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.5 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.42 
 
 		 608 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  30.05 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  37.18 
 
 		 847 aa  58.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0430  L-aspartate oxidase  26.02 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  23.35 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  23.35 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.77 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0420  L-aspartate oxidase  22.38 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  26.26 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  22.46 
 
 		 591 aa  57.8  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>