More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1275 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  100 
 
 		 528 aa  1090    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2561  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.54 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1684  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.92 
 
 		 541 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  24.72 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1756  L-aspartate oxidase  25.42 
 
 		 502 aa  134  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.863927  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.79 
 
 		 552 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  25.28 
 
 		 529 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  25.42 
 
 		 515 aa  128  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  24.44 
 
 		 538 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  25.33 
 
 		 532 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1547  L-aspartate oxidase  25.29 
 
 		 580 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.73 
 
 		 589 aa  123  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  23.8 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.56 
 
 		 644 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.05 
 
 		 546 aa  121  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  24.86 
 
 		 536 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.72 
 
 		 562 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  24.86 
 
 		 536 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  24.77 
 
 		 515 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.06 
 
 		 575 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.74 
 
 		 601 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.68 
 
 		 606 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  24.73 
 
 		 576 aa  120  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.39 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  25.6 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.04 
 
 		 617 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.63 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.05 
 
 		 539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.74 
 
 		 543 aa  118  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  24.14 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  23.45 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  24.25 
 
 		 538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  23.77 
 
 		 568 aa  117  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  22.86 
 
 		 598 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  23.77 
 
 		 511 aa  117  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  23.91 
 
 		 534 aa  117  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  25 
 
 		 531 aa  117  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.89 
 
 		 627 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  25.37 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  25.41 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  22.26 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.46 
 
 		 566 aa  114  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  23.5 
 
 		 533 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  25.33 
 
 		 535 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.48 
 
 		 598 aa  114  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  24.47 
 
 		 533 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.91 
 
 		 603 aa  114  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.88 
 
 		 638 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  24.82 
 
 		 556 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.86 
 
 		 599 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  26.78 
 
 		 539 aa  113  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  25.14 
 
 		 538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.51 
 
 		 542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  23.5 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.51 
 
 		 596 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  24.03 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.17 
 
 		 674 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  24.07 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.78 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.83 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3145  L-aspartate oxidase  24.72 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0480414  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  24.5 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  26.13 
 
 		 538 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.26 
 
 		 598 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.57 
 
 		 539 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  23.42 
 
 		 537 aa  110  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.99 
 
 		 674 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  25.36 
 
 		 532 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.16 
 
 		 567 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.72 
 
 		 626 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  24.5 
 
 		 525 aa  110  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  23.42 
 
 		 531 aa  110  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  23.5 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  23.89 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  24 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.28 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.3 
 
 		 602 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  23.32 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.92 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  24.11 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  23.93 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.41 
 
 		 542 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  24.89 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  22.5 
 
 		 596 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.33 
 
 		 567 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.25 
 
 		 596 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  24.24 
 
 		 541 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.25 
 
 		 596 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  23.62 
 
 		 518 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  25.87 
 
 		 519 aa  108  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  23.97 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  23.85 
 
 		 525 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  23.55 
 
 		 537 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  23.68 
 
 		 537 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.3 
 
 		 602 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  24.68 
 
 		 538 aa  107  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  24.73 
 
 		 538 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  23.55 
 
 		 537 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.47 
 
 		 668 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.3 
 
 		 602 aa  106  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>