More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2561 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2561  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
542 aa  1083    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  41.54 
 
 
528 aa  421  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1684  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.43 
 
 
541 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.35 
 
 
552 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.82 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  25.23 
 
 
531 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  25.72 
 
 
532 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  25.78 
 
 
533 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  25.63 
 
 
543 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  23.94 
 
 
534 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  23.94 
 
 
534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.03 
 
 
601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  26.34 
 
 
534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.94 
 
 
539 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  26.24 
 
 
537 aa  136  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  24.63 
 
 
531 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  25.88 
 
 
529 aa  136  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  24.4 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  23.96 
 
 
576 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  23.67 
 
 
573 aa  134  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.06 
 
 
539 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  23.88 
 
 
535 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  25.4 
 
 
555 aa  133  9e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0678  L-aspartate oxidase  28.97 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  25.77 
 
 
535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  25.09 
 
 
533 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  24.25 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  23.69 
 
 
538 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  24.44 
 
 
538 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  24.44 
 
 
538 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  25.84 
 
 
537 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  23.51 
 
 
534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1927  L-aspartate oxidase  24.59 
 
 
531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  23.82 
 
 
538 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03543  L-aspartate oxidase  24.95 
 
 
559 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  25.44 
 
 
531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  24.73 
 
 
533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  26.37 
 
 
532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0700  L-aspartate oxidase  24.63 
 
 
532 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130926  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  25.49 
 
 
537 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  26.44 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  23.33 
 
 
538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  23.51 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  25.66 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  26.26 
 
 
538 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002490  L-aspartate oxidase  23.71 
 
 
561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  23.83 
 
 
539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  25.31 
 
 
537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.9 
 
 
589 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  26.2 
 
 
531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  24.56 
 
 
555 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  23.04 
 
 
560 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  25.22 
 
 
537 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2315  L-aspartate oxidase  25.14 
 
 
528 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  24.04 
 
 
531 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  25.35 
 
 
531 aa  127  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  24.73 
 
 
533 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  24.04 
 
 
542 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  26.28 
 
 
531 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  24.01 
 
 
539 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  23.92 
 
 
533 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  23.92 
 
 
545 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  23.92 
 
 
533 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  24.78 
 
 
546 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  24.96 
 
 
537 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  24.96 
 
 
537 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  24.96 
 
 
537 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  24.83 
 
 
541 aa  124  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  24.43 
 
 
531 aa  124  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  22.94 
 
 
540 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  24.29 
 
 
537 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.61 
 
 
626 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  25.24 
 
 
541 aa  123  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  24.33 
 
 
537 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  25.78 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  24.19 
 
 
555 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  22.94 
 
 
540 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  23.06 
 
 
539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  24.11 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  22.94 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  22.82 
 
 
550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  23.79 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  23.65 
 
 
544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  22.94 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  24.32 
 
 
522 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  23.84 
 
 
533 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.49 
 
 
546 aa  121  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  24.55 
 
 
545 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  23.35 
 
 
543 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  22.87 
 
 
540 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  22.86 
 
 
540 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  22.52 
 
 
538 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  23.81 
 
 
542 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  22.63 
 
 
533 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  22.36 
 
 
538 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  22.62 
 
 
863 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  22.2 
 
 
540 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  24.41 
 
 
536 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  22.18 
 
 
540 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  29.78 
 
 
582 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>