More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1684 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1684  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 541 aa  1091    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2561  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.25 
 
 		 542 aa  224  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  28.92 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.05 
 
 		 601 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.01 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.41 
 
 		 542 aa  141  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1547  L-aspartate oxidase  29.83 
 
 		 580 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  24.05 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  25.18 
 
 		 545 aa  137  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.76 
 
 		 540 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.24 
 
 		 644 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  27.75 
 
 		 515 aa  134  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01151  L-aspartate oxidase  27.24 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.07 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.12 
 
 		 638 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01711  L-aspartate oxidase  25.27 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.507615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  24.45 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01161  L-aspartate oxidase  27.24 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.39 
 
 		 663 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.09 
 
 		 648 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.41 
 
 		 539 aa  127  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.38 
 
 		 627 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.92 
 
 		 648 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.92 
 
 		 648 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.24 
 
 		 663 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  26.9 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0104  L-aspartate oxidase  27.01 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.36 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.22 
 
 		 663 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.28 
 
 		 566 aa  125  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  26.89 
 
 		 532 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.24 
 
 		 543 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  24.5 
 
 		 534 aa  123  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  26.63 
 
 		 584 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1468  L-aspartate oxidase  25.82 
 
 		 566 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  24.32 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  25.78 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  23.29 
 
 		 538 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  24.51 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.35 
 
 		 668 aa  121  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  27.12 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  22.46 
 
 		 533 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  24.28 
 
 		 576 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  24.04 
 
 		 542 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.88 
 
 		 646 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02181  L-aspartate oxidase  24.02 
 
 		 556 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.75 
 
 		 539 aa  120  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  26.06 
 
 		 534 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  24.05 
 
 		 550 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.34 
 
 		 608 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1388  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.45 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.394605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.04 
 
 		 623 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  23.69 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  23.88 
 
 		 539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  25.27 
 
 		 573 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  25.28 
 
 		 557 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  23.69 
 
 		 540 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  24.35 
 
 		 582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  24.41 
 
 		 543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  23.97 
 
 		 542 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  22.76 
 
 		 542 aa  117  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  23.69 
 
 		 540 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  23.46 
 
 		 552 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  23.69 
 
 		 540 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24902  predicted protein  23.76 
 
 		 541 aa  116  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00163177  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  23.59 
 
 		 533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0614  L-aspartate oxidase  24.28 
 
 		 549 aa  116  1.0000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.42 
 
 		 552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  23.08 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  23.41 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.2 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.96 
 
 		 575 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  27.31 
 
 		 538 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.56 
 
 		 626 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.59 
 
 		 546 aa  115  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  23.75 
 
 		 537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  23.27 
 
 		 537 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  23.27 
 
 		 537 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.23 
 
 		 566 aa  114  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  23.27 
 
 		 537 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  22.73 
 
 		 539 aa  114  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  25.58 
 
 		 537 aa  114  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.1 
 
 		 662 aa  114  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  23.36 
 
 		 540 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  23.23 
 
 		 537 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  23.36 
 
 		 540 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.39 
 
 		 603 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.98 
 
 		 570 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  23.5 
 
 		 540 aa  113  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.05 
 
 		 542 aa  113  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.31 
 
 		 617 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  22.95 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  25.14 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  25.14 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  25.05 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  22.8 
 
 		 560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4339  L-aspartate oxidase  23.3 
 
 		 534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1097  L-aspartate oxidase  23.76 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.565133  normal  0.0527143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  23.09 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  23.09 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>