108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0517 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0493  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  99.85 
 
 		 664 aa  1365    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0517  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 		 664 aa  1366    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06460  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  45.66 
 
 		 753 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.76 
 
 		 679 aa  587  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0530357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4677  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.55 
 
 		 693 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04072  putative oxidoreductase  35.82 
 
 		 690 aa  363  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04034  hypothetical protein  36.8 
 
 		 682 aa  360  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3806  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.7 
 
 		 693 aa  360  7e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.168635 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4450  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.56 
 
 		 693 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0592294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4767  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.56 
 
 		 693 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.173311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1489  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.66 
 
 		 694 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.1 
 
 		 691 aa  350  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.429912  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1385  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.84 
 
 		 694 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.28 
 
 		 601 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.32 
 
 		 589 aa  133  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  23.92 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  24.11 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.87 
 
 		 543 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.73 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  23.64 
 
 		 532 aa  62  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4276  L-aspartate oxidase  22.05 
 
 		 519 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000385581  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.98 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.49 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  21.6 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.96 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  22.84 
 
 		 515 aa  57  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2104  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.98 
 
 		 574 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0119641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.19 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.84 
 
 		 598 aa  56.2  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  27.6 
 
 		 523 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  23.58 
 
 		 541 aa  55.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.8 
 
 		 539 aa  55.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  22 
 
 		 576 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  26.29 
 
 		 534 aa  55.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  24.27 
 
 		 538 aa  54.3  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.46 
 
 		 585 aa  54.3  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.54 
 
 		 626 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0330  L-aspartate oxidase  21.82 
 
 		 511 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  20.17 
 
 		 509 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  18.92 
 
 		 509 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  20.96 
 
 		 562 aa  52.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  24.1 
 
 		 538 aa  52  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  21.34 
 
 		 557 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.49 
 
 		 588 aa  51.6  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.49 
 
 		 588 aa  51.6  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1003  L-aspartate oxidase  28.85 
 
 		 534 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  19.19 
 
 		 509 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.83 
 
 		 539 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4510  L-aspartate oxidase  18.92 
 
 		 509 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.191844 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.36 
 
 		 539 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  23.17 
 
 		 533 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  28.28 
 
 		 565 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  22.16 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  22.17 
 
 		 598 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  22.53 
 
 		 594 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  27.53 
 
 		 525 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  28.74 
 
 		 530 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1776  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.56 
 
 		 584 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1275  FAD flavoprotein oxidase  25.8 
 
 		 528 aa  48.5  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  25 
 
 		 585 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.75 
 
 		 596 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4548  L-aspartate oxidase  19.69 
 
 		 509 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  20.23 
 
 		 509 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  26.1 
 
 		 555 aa  47.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.99 
 
 		 546 aa  47.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2006  L-aspartate oxidase  21.96 
 
 		 536 aa  47.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0189  L-aspartate oxidase  21.96 
 
 		 536 aa  47.8  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1684  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.15 
 
 		 541 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0437  L-aspartate oxidase  32.93 
 
 		 534 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.21 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3145  L-aspartate oxidase  27.97 
 
 		 502 aa  47.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0480414  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  22.99 
 
 		 557 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  25.16 
 
 		 532 aa  47.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  22.99 
 
 		 558 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0383  L-aspartate oxidase  22.54 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  26.16 
 
 		 571 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5132  L-aspartate oxidase  37.65 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.792013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  25.91 
 
 		 529 aa  46.2  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.67 
 
 		 669 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  26.09 
 
 		 552 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.67 
 
 		 669 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.33 
 
 		 542 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.67 
 
 		 669 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.67 
 
 		 669 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4515  L-aspartate oxidase  18.06 
 
 		 509 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  29.93 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  29.93 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.79 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  25.6 
 
 		 541 aa  45.8  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  29.3 
 
 		 579 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  24.9 
 
 		 574 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  22.55 
 
 		 550 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  34.25 
 
 		 515 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1793  L-aspartate oxidase  29.03 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.406  normal  0.410879 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  21.74 
 
 		 570 aa  45.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.49 
 
 		 596 aa  45.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  20.99 
 
 		 542 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  25.59 
 
 		 560 aa  44.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.12 
 
 		 583 aa  44.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0593  L-aspartate oxidase  22.27 
 
 		 511 aa  44.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.827824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>